Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  302  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99040184--99040529
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1.00
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.99
99082987--99083209
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2.8
80
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278
24
21
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28
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119
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2.3
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18
44
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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46
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14
7
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99180947--99181135
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35
18
20
25
1.95
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54
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17
20
26
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117
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4
21
1.33
99200614--99200670
22
2.8
20
79
10
60
70
5
1
22
1.17
99213084--99213125
21
2.0
21
90
0
66
64
7
0
28
1.20
99213097--99213153
21
2.6
21
81
10
62
66
5
3
24
1.28
99213101--99213149
15
3.3
15
76
0
53
67
4
4
24
1.26
99214000--99214032
12
2.7
13
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13
52
0
48
3
48
1.17
99215126--99215643
205
2.5
205
88
0
741
29
22
18
30
1.97
99225942--99225983
21
2.0
21
90
0
66
64
7
0
28
1.20
99228054--99228111
22
2.6
22
81
7
64
41
17
5
36
1.72
99228090--99228145
19
2.9
19
94
0
103
35
17
10
35
1.85
99228798--99229163
44
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44
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7
294
30
22
16
30
1.96
99228769--99229122
132
2.7
131
88
4
512
28
22
16
31
1.96
99229190--99229277
44
2.0
44
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4
133
30
28
14
26
1.95
99229298--99230113
84
9.6
85
87
3
1122
22
21
22
32
1.98
99229298--99230112
255
3.2
253
86
4
1138
22
21
22
32
1.98
99229298--99230113
171
4.8
171
89
1
1226
22
21
22
32
1.98
99231055--99231120
7
9.4
7
81
14
66
3
12
0
84
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99231055--99231117
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21
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17
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3
12
0
84
0.75
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19
3.9
19
83
8
105
34
16
9
38
1.82
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29
2.2
29
85
0
92
46
21
0
31
1.52
99253914--99253967
14
3.8
14
78
4
54
48
20
0
31
1.50
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31
2.1
31
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12
4
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1.54
99258245--99258354
3
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3
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1
7
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0
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0
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0
0
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27
2.8
28
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115
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5
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4.2
44
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25
26
17
30
1.97
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205
4.4
205
92
2
1425
29
21
18
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1.97
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15
2.0
15
100
0
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20
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2.1
15
100
0
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6
38
0
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1.82
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2.3
75
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14
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32
1.90
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4.6
35
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23
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35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
99279797--99279968
75
2.4
73
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8
226
33
23
11
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1.90
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3
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3
68
14
100
58
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7
31
1.42
99282631--99282701
8
8.1
8
71
17
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64
4
2
28
1.26
99282887--99282918
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2.0
16
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0
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21
21
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16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99283644--99283718
26
2.7
28
83
10
100
50
18
5
25
1.68
99283643--99283726
26
3.2
26
86
6
98
45
20
4
29
1.71
99296886--99296942
28
2.0
28
100
0
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17
28
1.93
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5
9.0
5
80
9
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80
4
0
15
0.87
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3.9
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90
9
62
82
5
0
12
0.83
99300169--99300215
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15
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11
53
80
4
0
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2.6
28
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0
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25
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1.92
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2.0
65
85
0
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1.98
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2.0
21
90
0
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39
17
0
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1.49
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19
2.5
20
83
13
55
39
4
0
56
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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