Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  47  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14949957--14950025
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1
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0
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143
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28
22
13
34
1.93
15029205--15029571
98
3.7
98
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503
28
22
14
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
196
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13
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2.0
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22
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22
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20.0
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74
13
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0
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1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
43
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
15250854--15250908
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3.4
16
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92
34
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29
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0
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13
37
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27
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0
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20
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71
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0
0
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28
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0
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43
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0
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0
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0
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2.0
26
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0
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5
100
0
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0
0
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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2
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5
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9
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13
56
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1
1
32
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15387235--15387331
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2.0
20
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0
0
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6
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41
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0
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0
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191
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1.84
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3.9
30
75
9
101
60
5
1
32
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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