Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1517442--1517513
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2.6
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1.9
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41
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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156
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21
14
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28
3.6
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15
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1.9
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95
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40
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252
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18
16
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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17
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25
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124
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32
4
15
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1704607--1704688
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132
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1.64
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0
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10
0
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59
1.31
1760919--1761002
29
2.8
30
80
7
91
55
5
2
35
1.37
1760919--1760998
28
2.8
29
82
3
90
56
5
2
36
1.35
1769470--1769519
20
2.4
22
83
16
70
64
0
0
36
0.94
1771204--1771252
15
3.4
15
75
18
59
55
2
0
42
1.11
1771201--1771258
27
2.2
26
90
9
91
51
1
0
46
1.11
1773699--1773738
18
2.2
18
86
4
53
47
0
0
52
1.00
1773701--1773743
17
2.4
19
81
18
56
46
0
0
53
1.00
1780325--1780412
43
2.0
43
95
0
158
40
14
23
20
1.90
1781513--1781559
21
2.2
22
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3
78
21
38
19
21
1.94
1784662--1784742
29
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29
11
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51
1.64
1785928--1786044
4
29.2
4
98
0
225
49
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0
26
1.50
1786216--1786267
26
2.0
26
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0
104
23
26
11
38
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1789476--1789516
20
2.2
20
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8
59
39
7
2
51
1.43
1795801--1795830
6
5.0
6
100
0
60
83
0
0
16
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1796985--1797062
32
2.5
33
81
8
99
37
1
6
55
1.34
1799942--1799984
6
7.2
6
94
0
50
0
0
60
39
0.97
1799950--1799993
6
7.3
6
94
0
61
0
2
54
43
1.12
1801230--1801256
14
1.9
14
100
0
54
0
7
0
92
0.38
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26
2.0
24
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7
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3
1
39
1.30
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4
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4
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11
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21
3
1
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1.09
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28
2.7
23
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19
4
30
45
1.70
1821047--1821130
28
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28
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1
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19
3
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14
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14
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0
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0
0.91
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10
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0
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0
25
0
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15
2.3
15
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10
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0
12
12
1.04
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3
10.3
3
100
0
62
67
0
0
32
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20
1.9
20
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0
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36
13
7
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1.73
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17
2.6
17
87
12
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32
15
6
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1.71
1823684--1823760
17
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17
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17
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13
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34
12
13
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1823684--1823771
34
2.5
35
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10
101
31
11
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1.78
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44
2.1
44
88
8
134
22
11
14
51
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1823718--1823866
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2.4
63
82
10
182
30
10
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17
13.9
19
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20
120
32
12
10
44
1.75
1823767--1824026
18
14.1
18
69
21
103
32
11
10
45
1.75
1823731--1823825
45
2.1
44
81
9
104
27
11
11
49
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1823831--1823873
22
2.0
21
90
4
68
39
11
9
39
1.74
1823867--1823919
15
3.4
15
82
10
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37
9
7
45
1.65
1824890--1824954
27
2.3
27
81
7
67
38
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20
1.77
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12
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0
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0
25
0
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16
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0
53
54
3
0
41
1.16
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100
0
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0
0
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0
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18
19
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15
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11
16
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1.85
1839063--1839208
53
2.7
53
90
4
213
26
15
28
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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