Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  291  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95715208--95715253
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24
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0
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24
1.9
24
90
0
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1.53
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3.0
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4
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3
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29
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1.99
95728323--95728634
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3.9
80
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0
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25
29
21
24
1.99
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1.9
16
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2.1
27
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2.0
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24
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3.1
53
88
6
221
25
15
28
30
1.96
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9
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0
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80
0
0
19
0.71
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27
23
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2.2
134
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438
28
21
17
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1.96
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89
3.1
90
79
4
241
27
24
16
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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17
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1.96
95762887--95763021
46
2.9
46
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146
27
22
16
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1.95
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2.1
26
100
0
110
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16
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3
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64
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2
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3
2
31
1.23
95769666--95769731
29
2.3
29
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63
0
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871
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21
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186
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2.1
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2
39
1.41
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26
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44
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0
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22
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1.94
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2.0
20
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0
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0
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34
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0
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1.28
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2.3
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1
7
56
1.36
95791800--95791853
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2.4
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1.84
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38
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21
21
24
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2.1
43
91
4
146
13
20
33
33
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95811687--95811735
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3.2
16
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1
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1.59
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2.3
53
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3.8
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78
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20
28
29
1.98
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1.8
93
92
2
290
22
19
28
28
1.98
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20
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2
2
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1.10
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136
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95878277--95878361
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2
24
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0
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0
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2.3
158
78
7
379
34
13
22
29
1.93
95880442--95880503
25
2.4
25
97
2
115
0
45
19
35
1.51
95883508--95883590
41
2.0
41
100
0
166
40
9
9
39
1.71
95884447--95884509
21
3.1
21
77
13
78
47
20
1
30
1.60
95884423--95884511
39
2.3
39
82
0
106
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21
2
32
1.65
95884410--95884513
9
10.9
9
71
11
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45
19
1
33
1.61
95890518--95890772
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5.9
43
94
0
438
23
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18
24
1.97
95890512--95890780
87
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86
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2
448
26
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18
23
1.97
95890519--95890773
130
2.0
130
96
0
465
24
32
18
24
1.97
95892050--95892113
13
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13
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0
56
37
6
20
35
1.78
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2.1
57
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0
225
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23
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95895863--95895936
17
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17
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1.22
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6
2
27
1.31
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3.5
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28
0
2
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1.03
95896261--95896316
22
2.6
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0
3
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1.02
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47
2.0
47
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0
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17
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34
1.90
95901934--95902010
38
2.0
38
100
0
154
15
23
12
48
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
44
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4
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33
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3
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3
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0
0
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19
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21
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12
12
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1.31
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2.0
15
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0
0
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1
0.95
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0
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20
1.96
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2.0
32
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0
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0
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0
0
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0
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0
0
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0
0
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9
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39
12
24
24
1.89
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2.5
30
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118
40
7
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23
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1.8
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383
37
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23
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30
2.5
30
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4
100
39
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22
26
1.88
95952291--95952599
150
2.1
149
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379
37
13
23
24
1.91
95955873--95955926
4
13.8
4
80
3
56
68
1
5
24
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95958582--95958764
79
2.3
81
83
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223
25
27
22
25
2.00
95958561--95958764
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5.1
40
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8
220
25
27
22
25
2.00
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2.0
47
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0
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0
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16
16
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18
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0
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23
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0
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3.5
11
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0
60
30
2
0
66
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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