Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  62  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19413711--19413776
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0
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2.5
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2.4
24
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1.81
19435151--19435281
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0
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0
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2.0
20
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19459383--19459540
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35
22
24
18
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22
18
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2.9
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37
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21
19
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2.5
10
100
0
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8
48
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19486501--19486566
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29
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2.3
30
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2.5
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47
2
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1.44
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2.3
15
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18
1.28
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2.8
13
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58
44
13
0
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1.43
19568128--19568191
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2.1
31
100
0
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17
1.95
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2.3
31
92
0
115
23
39
22
14
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.34
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0
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64
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1.36
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11
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1.34
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13
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23
1.92
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2.8
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22
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58
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0
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0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19620671--19620751
29
2.6
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0
1
60
1.05
19621959--19622075
51
2.3
51
91
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182
40
10
23
26
1.86
19622742--19622770
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1.9
15
100
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29
1.77
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3.6
48
82
7
187
24
17
28
29
1.97
19634330--19634373
24
1.9
22
81
9
52
45
6
22
25
1.77
19639896--19639935
17
2.4
17
86
0
53
47
0
2
50
1.14
19641325--19641362
16
2.4
16
86
4
51
36
2
0
60
1.11
19642008--19642052
22
2.0
23
83
12
58
40
11
2
46
1.52
19653851--19654323
119
4.0
119
94
0
786
32
15
20
31
1.94
19654623--19654699
40
1.9
40
97
0
145
29
12
24
32
1.93
19656365--19656397
8
4.2
8
84
7
50
30
0
0
69
0.88
19656367--19656429
10
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11
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23
52
33
0
1
65
1.03
19656365--19656394
15
2.0
15
93
0
51
30
0
0
70
0.88
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2.2
22
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11
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34
6
2
57
1.36
19656906--19656950
22
2.0
23
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12
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11
2
46
1.52
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15
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46
0
1
51
1.12
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28
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28
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49
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1.36
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13
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14
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0
0
42
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26
2.9
25
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11
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57
1
1
40
1.16
19663202--19663252
26
2.0
26
92
0
84
37
11
13
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19669038--19669082
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2.0
22
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8
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15
11
0
73
1.10
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49
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49
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0
200
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6
6
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2.4
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39
0
0
60
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6.3
39
80
0
260
39
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14
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1.87
19682017--19682267
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2.1
117
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2
290
39
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13
31
1.87
19695984--19696018
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1.9
18
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0
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0
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1.56
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0
0
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0
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30
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10
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0
13
1.10
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12
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23
24
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19713213--19713605
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4.5
88
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2
589
29
22
23
24
1.99
19713249--19713489
43
5.5
44
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15
185
26
21
24
26
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44
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15
248
30
21
22
25
1.99
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3.1
174
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2
861
31
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22
25
1.98
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5.5
44
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14
161
31
19
21
26
1.97
19713649--19714195
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6.3
87
72
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407
30
21
22
25
1.99
19713909--19714199
44
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44
74
11
132
29
21
23
25
1.99
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9
3.4
9
95
4
53
10
53
13
23
1.69
19720829--19720857
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3.2
9
100
0
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0
10
0.94
19723000--19723226
44
5.2
44
66
12
169
27
24
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19722994--19723386
88
4.5
88
91
2
589
29
22
23
24
1.99
19723030--19723270
43
5.5
44
69
15
185
26
21
24
26
2.00
19723467--19723979
46
11.7
44
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15
248
30
21
22
25
1.99
19723367--19723903
174
3.1
174
92
2
861
31
19
22
25
1.98
19723565--19723802
44
5.5
44
69
14
161
31
19
21
26
1.97
19723430--19723976
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6.3
87
72
8
407
30
21
22
25
1.99
19723690--19723980
44
6.7
44
74
11
132
29
21
23
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10
53
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3.0
122
99
0
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7
15
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12
3.7
12
78
15
58
23
0
12
63
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352