Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  129  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.5
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26
1.97
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30
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25
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0
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18
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38
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21
22
25
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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40
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27
20
24
1.99
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19
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42921239--42921352
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9
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1.80
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0
0
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1.95
42923148--42923344
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31
29
16
22
1.95
42923138--42923402
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1.97
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3.5
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1.98
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2.1
19
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10
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21
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2.0
20
84
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46
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2.0
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2.3
17
100
0
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12
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58
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
26
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41
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
42976340--42976527
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1.41
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120
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50
0
5
44
1.26
42976605--42976799
93
2.1
92
88
4
286
47
4
4
44
1.41
42983040--42983079
20
2.0
20
85
0
53
47
2
5
45
1.38
42987529--42987562
16
2.1
16
88
0
50
50
2
11
35
1.54
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3.3
32
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112
38
2
1
57
1.24
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9
3.0
10
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10
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0
20
0
79
0.74
42991270--42991298
5
6.0
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8
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0
20
0
79
0.74
42995886--42995913
6
4.7
6
100
0
56
85
0
14
0
0.59
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15
3.5
15
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0
3
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1.18
43010124--43010158
11
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11
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0
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20
11
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34
1.88
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25
2.0
25
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0
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10
0
44
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11
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23
17
28
1.97
43037131--43037245
43
2.7
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142
20
21
28
28
1.98
43037131--43037237
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2.5
42
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1
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28
28
1.99
43039538--43039576
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1.9
21
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5
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23
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1.87
43040598--43040714
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2.1
57
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0
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49
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23
26
19
29
1.99
43041015--43041139
48
2.6
48
77
5
130
27
26
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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0
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26
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1.99
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30
2.0
30
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0
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25
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1.85
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1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
43055047--43055219
46
3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
43055642--43055701
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2.0
30
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0
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30
25
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1.85
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11
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24
17
26
31
1.97
43061515--43061675
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1.9
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202
24
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1.97
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201
25
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1.98
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1.8
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29
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1.98
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140
1.8
140
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30
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26
1.97
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13
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25
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1.97
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4.6
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2.0
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3
34
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43077397--43077452
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20
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2.1
19
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65
0
2
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1.06
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2.0
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0
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1.14
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13
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0
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1.66
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2.1
17
89
0
54
66
5
5
22
1.34
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10
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0
36
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17
2.0
17
88
0
50
35
2
11
50
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43080856--43080883
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0
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0
0
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29
2.0
28
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3
78
71
0
0
28
0.86
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36
2.0
36
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22
15
2
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1.50
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1.9
21
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57
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5
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20
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0
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41
3.6
42
78
6
141
30
15
24
30
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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