Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  59  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17926037--17926136
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49
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0
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2.0
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0
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10
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3
0
70
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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21
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2
5
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2.0
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28
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2.7
206
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2.0
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9
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18004881--18004933
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61
0
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69
0.99
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521
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38
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1.54
18023148--18023190
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2.0
22
90
4
70
39
44
0
16
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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199
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1.96
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2.0
20
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20
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202
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28
1.97
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29
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28
1.95
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2.7
28
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11
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1.92
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19
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2.8
26
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108
28
23
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18067436--18067533
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22
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1.84
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11
28
1.88
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54
3.2
56
77
11
139
41
20
7
31
1.80
18071354--18071423
25
2.8
25
91
0
104
28
25
21
24
1.99
18071379--18071450
25
3.0
24
80
13
76
29
22
22
26
1.99
18071643--18071725
31
2.7
30
92
7
141
28
14
26
30
1.95
18077019--18077223
27
7.6
27
86
3
259
30
27
15
26
1.96
18085312--18085516
27
7.6
27
86
3
259
30
27
15
26
1.96
18091946--18092003
30
1.9
31
82
3
73
53
1
13
31
1.50
18092368--18092551
39
4.7
39
85
1
217
19
32
15
33
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18092398--18092496
19
5.0
21
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22
70
16
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16
36
1.91
18092382--18092572
39
4.9
40
83
2
165
19
30
15
35
1.92
18102965--18103026
32
1.9
32
83
6
81
43
8
8
40
1.64
18103185--18103217
17
1.9
17
88
11
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45
3
3
48
1.33
18103375--18103427
22
2.4
22
75
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33
3
1
60
1.26
18112625--18112665
22
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22
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41
7
7
43
1.60
18113851--18113875
11
2.3
11
100
0
50
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0
0
68
0.90
18115360--18115401
18
2.3
18
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0
57
19
28
7
45
1.76
18117418--18117475
21
2.8
21
83
0
71
31
36
20
12
1.89
18119105--18119328
48
4.7
48
87
3
299
33
25
19
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18127713--18127820
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
18129445--18129582
27
5.1
27
83
5
163
20
23
21
34
1.97
18129445--18129582
54
2.5
53
89
2
195
20
23
21
34
1.97
18134837--18134963
26
5.2
26
86
10
187
33
7
22
36
1.83
18134837--18134963
46
2.6
49
89
9
190
33
7
22
36
1.83
18136394--18136467
26
2.8
26
85
6
87
33
22
12
31
1.91
18136572--18136712
54
2.6
53
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2
237
17
24
24
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1.95
18136572--18136730
27
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27
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11
193
18
24
22
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1.96
18138614--18138669
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2.0
28
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0
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11
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33
4
0
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1.17
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9
5.8
9
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18
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33
0
3
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1.12
18138907--18138970
21
3.1
21
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31
1
4
62
1.25
18141001--18141177
88
2.0
89
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1
338
37
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19
25
1.94
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94
2.0
94
97
2
360
18
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1.92
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2.0
93
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1
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17
24
1.90
18151145--18151700
206
2.7
205
92
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22
28
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17
2.0
17
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11
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26
8
0
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1.22
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2.5
12
100
0
60
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0
0
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0.92
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2.5
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20
52
26
5
0
67
1.13
18159268--18159404
57
2.4
57
88
0
202
31
24
17
27
1.97
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125
3.2
125
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3
568
30
16
16
37
1.91
18166802--18166929
34
3.7
33
77
6
121
42
14
0
41
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18168062--18168174
55
2.1
55
100
0
226
39
14
14
31
1.85
18168305--18168349
14
3.3
13
79
11
54
64
0
0
35
0.94
18169722--18170111
195
2.0
196
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1
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35
18
16
29
1.93
18176385--18176438
27
2.0
27
96
0
99
33
16
7
42
1.76
18183269--18183328
25
2.4
25
83
8
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35
3
5
56
1.37
18183288--18183341
25
2.2
25
83
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1
1
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1.20
18209832--18209858
8
3.4
8
100
0
54
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37
0
25
1.57
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4
178
27
15
27
29
1.96
18211725--18211874
82
1.8
81
88
4
230
26
15
28
30
1.96
18212824--18212862
18
2.2
18
100
0
78
30
15
25
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362