Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2013516--2013575
26
2.3
26
80
5
68
38
1
5
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1.32
2013672--2013736
30
2.1
31
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2
87
58
4
1
35
1.28
2020046--2020077
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2.1
15
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5
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6.0
6
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0
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16
0
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1.46
2021182--2021241
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4.8
12
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8
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50
1
1
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1.21
2021184--2021231
25
1.9
25
83
8
62
47
2
2
47
1.25
2021334--2021365
15
2.2
15
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5
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6
6
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1.54
2025216--2025262
18
2.5
19
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2
2
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2.0
31
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0
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1.72
2028953--2029024
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2.6
28
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112
30
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1.57
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0
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0
0
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2.0
35
100
0
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14
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2.1
32
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10
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53
14
1
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1.50
2047355--2047493
60
2.3
60
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11
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35
13
10
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1.80
2048388--2048421
13
2.5
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2
0
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2.0
18
100
0
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16
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20
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11
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1
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1.09
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14
82
5
62
76
0
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14
1.01
2061505--2061559
18
3.1
18
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2
58
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1
10
12
1.15
2062171--2062277
45
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45
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153
20
18
18
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1.90
2062273--2062299
12
2.2
12
100
0
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18
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14
40
1.89
2064814--2064864
25
2.0
25
100
0
102
27
15
11
45
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2064896--2064963
32
2.2
32
83
2
84
30
14
5
48
1.68
2080002--2080123
58
2.0
60
84
4
158
48
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1.73
2085656--2085692
12
3.0
13
84
11
51
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0
0
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26
2.0
26
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3
70
61
0
0
38
0.96
2086633--2086691
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1.9
31
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3
84
42
13
6
37
1.71
2086999--2087069
32
2.2
33
84
2
99
38
16
16
28
1.91
2087878--2088363
259
1.9
260
99
0
965
35
15
16
31
1.91
2090407--2090495
38
2.3
38
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5
106
39
1
6
52
1.35
2091132--2091167
17
2.0
19
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10
58
63
5
0
30
1.17
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95
0
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2
0
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11.0
3
100
0
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33
0
0
66
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2.0
71
95
0
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19
14
33
1.93
2100230--2100334
53
2.0
53
96
1
194
40
17
20
21
1.91
2107571--2107610
20
2.0
20
85
9
55
70
5
10
15
1.32
2108960--2109001
5
9.0
5
85
15
63
38
0
0
61
0.96
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17
2.1
17
100
0
70
40
20
22
17
1.92
2118618--2118688
28
2.5
28
88
0
97
50
8
2
38
1.47
2118618--2118688
14
5.1
14
70
13
56
50
8
2
38
1.47
2122206--2122262
25
2.2
25
81
9
62
31
7
8
52
1.59
2122709--2122758
16
3.1
16
74
8
57
52
32
0
16
1.44
2123774--2123821
3
15.7
3
82
4
60
31
2
4
62
1.26
2125275--2125320
17
2.5
20
80
20
64
56
4
6
32
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2125508--2125546
15
2.6
16
84
12
55
56
5
0
38
1.22
2125584--2125643
29
2.0
30
81
9
70
63
3
3
30
1.27
2127177--2128357
154
7.7
148
77
11
1017
33
19
16
31
1.93
2127166--2128205
72
13.7
73
79
9
923
33
19
15
31
1.93
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91
2.0
88
85
5
235
32
18
20
29
1.96
2128209--2128479
62
3.9
72
76
18
270
29
24
17
28
1.97
2128041--2128351
165
1.9
162
89
3
480
30
19
18
31
1.96
2128209--2128351
74
1.9
75
88
2
216
27
22
18
31
1.97
2128282--2128475
68
3.0
65
81
7
250
30
26
17
25
1.97
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19
4.3
19
69
24
63
56
5
5
31
1.46
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2
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100
0
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0
0
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11
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4
0
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1.17
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29
2.0
30
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9
70
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3
3
30
1.27
2141285--2141337
26
2.0
26
82
7
63
26
15
20
37
1.92
2142828--2142911
26
3.2
26
94
0
141
35
25
5
33
1.80
2144252--2144282
15
2.1
15
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0
53
32
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1.31
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16
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33
7
7
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1.59
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27
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25
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0
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21
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11
22
0
1.23
2169161--2169272
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39
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8
111
22
20
27
29
1.98
2171167--2171196
4
7.5
4
92
0
51
73
0
3
23
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2172072--2172106
15
2.3
15
90
9
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60
2
2
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1.26
2187710--2187789
23
3.2
25
62
21
58
66
11
22
0
1.23
2189181--2189292
37
2.9
39
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111
22
20
27
29
1.98
2191186--2191215
4
7.5
4
92
0
51
73
0
3
23
0.98
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21
3.4
21
92
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28
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26
24
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2195959--2196045
21
4.0
21
86
5
120
33
26
24
16
1.95
2196415--2196468
15
3.5
15
87
2
81
51
11
0
37
1.37
2197742--2197778
5
7.2
5
96
3
65
56
0
0
43
0.99
2204781--2204820
16
2.5
16
83
0
53
47
5
0
47
1.24
2210381--2210423
19
2.3
19
80
15
54
60
0
0
39
0.97
2210931--2210971
8
4.6
9
83
16
50
34
0
2
63
1.08
2211895--2211940
21
2.1
22
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11
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43
0
2
54
1.12
2214275--2214320
12
3.9
12
81
13
51
60
0
0
39
0.97
2214276--2214320
14
3.3
15
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14
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60
0
0
40
0.97
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20
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59
0
0
40
0.97
2214420--2214461
19
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18
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2
50
1.61
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13
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7
80
39
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1.75
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27
2.0
27
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7
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63
5
0
30
1.18
2223550--2223601
22
2.4
22
84
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63
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9
0
19
1.13
2223554--2223601
21
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20
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10
0
16
1.10
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15
2.4
15
85
0
54
36
0
8
55
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2224195--2224264
22
3.2
21
76
15
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31
4
5
58
1.41
2224485--2224529
20
2.3
19
82
14
56
35
4
6
53
1.47
2229936--2229979
20
2.1
20
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8
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15
22
0
61
1.34
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37
2.1
37
100
0
152
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23
7
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3.2
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1.80
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1.9
25
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0
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29
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1.75
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22
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0
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20
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24
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8
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1
5
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1.35
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2.3
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39
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0
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11
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5
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0
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26
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25
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0
0
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3
0
12
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2277895--2277927
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17
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0
12
0.72
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3
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3
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0
0
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30
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1
2
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16
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8
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0
0
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2.0
23
100
0
92
21
21
8
47
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2300314--2300347
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11.0
3
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50
61
0
0
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0.96
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2.0
20
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0
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1.58
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2.1
21
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8
61
66
0
0
33
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1.9
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0
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20
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0
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0
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0
0
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2.7
31
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7
84
41
9
5
43
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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