Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  237  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80089030--80089059
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15
0
60
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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28
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20
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2.5
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2.0
26
96
0
93
11
23
35
29
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.98
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1.23
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20
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3.5
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135
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3.0
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12
25
32
1.92
80293849--80293960
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4.0
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100
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15
279
25
2
27
43
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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202
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202
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1
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1.68
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28
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19
1
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1.58
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41
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14
2.2
13
94
5
51
50
0
13
36
1.42
80320603--80320826
40
5.6
40
86
3
281
24
21
26
27
1.99
80320602--80320826
81
2.8
80
88
2
310
24
21
27
27
1.99
80328729--80328923
81
2.4
80
91
2
302
23
22
28
26
1.99
80328730--80328923
40
4.8
40
87
4
282
23
22
27
26
1.99
80334445--80334658
86
2.5
87
85
1
270
30
27
18
23
1.98
80334445--80334658
43
5.0
43
82
1
232
30
27
18
23
1.98
80341961--80342021
30
2.0
30
83
0
77
31
21
8
39
1.82
80355249--80355517
47
5.7
46
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9
159
31
19
27
21
1.97
80355252--80355518
91
2.9
93
71
12
240
31
19
26
21
1.97
80357336--80357370
16
2.1
17
89
5
54
20
0
25
54
1.45
80357558--80357591
16
2.1
17
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5
52
52
32
0
14
1.42
80363936--80363966
13
2.4
13
100
0
62
48
6
6
38
1.55
80364396--80364471
28
2.7
29
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13
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10
30
1.88
80366952--80367019
30
2.3
30
100
0
136
44
2
32
20
1.67
80369532--80369860
48
6.9
48
97
0
595
34
6
28
30
1.82
80370005--80370103
37
2.7
37
93
0
171
24
18
32
25
1.97
80373078--80373344
46
5.8
46
73
15
235
21
20
29
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80373122--80373283
47
3.5
47
74
14
172
21
19
29
30
1.97
80373072--80373337
93
2.9
93
92
0
442
21
20
29
28
1.98
80378017--80378118
29
3.6
29
85
2
136
27
15
28
28
1.96
80388091--80388159
28
2.5
28
83
4
77
36
21
13
28
1.91
80393517--80394076
43
13.0
43
78
1
444
38
21
13
25
1.91
80393525--80394015
129
3.8
128
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1
498
37
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14
26
1.92
80406661--80406713
19
2.7
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1
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1.63
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1.23
80415969--80416020
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1.94
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1.9
39
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134
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21
1.97
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29
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1.96
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2.0
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30
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16
26
1.97
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3.4
13
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47
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1.80
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2.7
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1.95
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22
2.0
22
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0
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1.80
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9
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0
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1.77
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2.0
30
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132
1.9
132
84
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331
35
20
16
26
1.95
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2.2
35
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57
7
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28
1.51
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24
0
2
73
0.95
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43
2.3
42
82
5
108
60
3
1
35
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80462254--80462311
30
1.9
30
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58
0
1
39
1.08
80467586--80467614
5
5.8
5
100
0
58
37
0
0
62
0.96
80469269--80469309
22
2.0
21
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1.84
80473339--80473493
39
3.9
39
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0
220
30
29
20
20
1.97
80473335--80473522
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4.8
40
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2
211
29
28
20
20
1.98
80477143--80477180
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2.8
14
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34
0
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1.45
80477145--80477180
7
5.3
7
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0
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2
0
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1.12
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2.3
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2
0
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1.12
80501790--80501971
40
4.6
40
90
2
269
28
25
22
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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