Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10261821--10261869
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2.0
25
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0
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30
0
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64
1.14
10262032--10262084
24
2.2
25
83
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30
0
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1.10
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18
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82
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20
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10
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1.9
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93
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21
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30
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21
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116
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1.98
10274664--10274745
42
2.0
42
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0
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29
15
25
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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0
0
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51
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28
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10284296--10284579
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372
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16
28
28
1.97
10291407--10291627
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4.6
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9
227
27
16
28
28
1.97
10291395--10291627
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2.4
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2
308
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15
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1.96
10296576--10296632
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2.2
26
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3
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21
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58
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2.0
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11
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18
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2.0
20
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52
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134
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12
19
1.88
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19
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2.0
26
100
0
104
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30
3
15
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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2.0
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1
18
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2.0
21
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4
22
1.27
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2.0
23
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21
1.46
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1.97
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1.9
353
83
3
888
26
23
19
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10427431--10427581
44
3.5
42
82
6
144
28
24
21
25
1.99
10427467--10427586
41
2.8
44
85
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140
26
26
20
26
1.99
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0
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0
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0.89
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38
83
5
103
57
7
5
29
1.50
10446248--10446287
22
1.9
22
85
10
57
42
5
12
40
1.64
10450458--10450521
31
2.2
30
83
10
80
20
7
23
48
1.75
10457063--10457143
35
2.3
35
78
0
90
22
30
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27
1.98
10464235--10464296
31
2.0
32
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90
38
14
8
38
1.76
10468346--10468428
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3.2
26
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16
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42
10
25
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1.85
10474045--10474072
2
14.0
2
100
0
56
0
50
0
50
1.00
10475462--10475487
6
4.3
6
100
0
52
30
0
0
69
0.89
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19
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21
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11
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1
1
32
1.15
10478629--10478703
26
2.9
26
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2
125
69
5
0
25
1.09
10478666--10478712
17
2.7
17
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3
58
70
2
0
27
0.99
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9
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9
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18
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4
0
28
1.12
10478600--10478849
9
25.4
10
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1.23
10478611--10478737
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109
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3
0
29
1.15
10478777--10478849
20
3.7
20
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13
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64
0
5
30
1.16
10486732--10486779
24
2.0
24
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50
0
6
43
1.27
10486751--10486785
10
3.4
10
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7
52
51
0
2
45
1.16
10493770--10493843
33
2.2
33
87
0
103
20
8
28
43
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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0
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28
0
35
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32
2.7
35
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13
107
48
3
0
48
1.18
10498321--10498369
25
1.9
26
87
4
73
51
4
0
44
1.20
10498532--10498569
12
3.1
12
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17
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2
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15
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32
1.81
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0
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20
1.85
10516231--10516265
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20
20
1.85
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2.2
59
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8
156
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20
18
19
1.91
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3
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3
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0
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0
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0
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2.1
25
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2
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1.58
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2.1
12
100
0
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38
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2.0
43
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203
2.0
203
88
0
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27
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19
20
1.97
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2.4
13
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0
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1.82
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20
2.2
20
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20
13
1.80
10569021--10569068
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2.1
22
85
11
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43
1.60
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2.1
17
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0
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18
3.0
17
77
5
52
37
3
0
58
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10581341--10581395
19
2.8
21
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10
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0
0
43
0.99
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2.9
19
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2
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55
0
0
44
0.99
10581390--10581462
29
2.5
29
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1
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2.0
29
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0
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1
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14
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1.70
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1.70
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1.73
10588209--10588272
20
3.2
20
65
20
53
21
9
15
53
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362