Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  350  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116053695--116053756
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5.0
13
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1
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32
1.37
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0
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2.0
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59
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2
2
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3.5
50
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0
258
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20
25
1.94
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3.8
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0
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27
27
1.98
116063705--116063876
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9
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28
1.95
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8
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62
5
0
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1.17
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0
0
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25
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20
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26
1.80
116086219--116086297
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2.2
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6
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44
20
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26
1.80
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0
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2
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88
0
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116092513--116092555
20
2.2
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0
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0
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27
16
27
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22.4
44
88
2
1459
28
17
31
21
1.96
116106041--116107013
260
3.7
257
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2
1450
28
17
31
21
1.96
116106041--116107013
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3.2
304
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1
1508
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17
31
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1.96
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2.7
10
100
0
54
92
0
0
7
0.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6
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19
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0
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10
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83
26
28
18
26
1.98
116109827--116109872
20
2.4
19
85
7
74
30
28
15
26
1.96
116113740--116113771
17
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0
0
25
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2.1
29
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79
18
6
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73
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116118855--116118928
29
2.5
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82
10
89
50
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8
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0
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29
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0
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2
0
32
1.07
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2.6
30
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60
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2.1
17
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0
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2
2
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21
2.0
21
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2
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66
1.27
116170385--116170417
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2.4
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24
0
3
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18
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0
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0
0
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62
0
3
34
1.12
116185457--116185525
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2.2
31
82
5
86
36
13
10
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116188265--116188310
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2.2
21
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58
34
0
6
58
1.24
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20
2.5
20
96
0
93
35
15
23
25
1.94
116189793--116189837
22
2.0
23
87
12
67
62
4
6
26
1.39
116195567--116195609
22
2.0
22
81
9
52
23
2
0
74
0.93
116195616--116195656
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3.4
12
78
21
50
56
0
0
43
0.99
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2.1
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16
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0
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1.9
188
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5
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1
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56
0
0
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3.1
22
82
10
75
57
1
0
40
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116257738--116257779
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0
0
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0
15
0.97
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60
63
3
9
23
1.40
116272481--116272522
20
2.1
19
83
16
50
61
0
11
26
1.30
116273278--116273317
21
1.9
21
89
0
62
30
37
7
25
1.83
116273948--116274015
21
3.3
21
70
11
61
11
11
16
60
1.59
116274115--116274361
41
6.3
41
80
12
302
32
20
25
21
1.97
116274164--116274227
32
2.0
32
93
0
110
29
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28
26
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116274978--116275026
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2.0
24
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2
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40
1.32
116275308--116275460
7
21.6
7
72
7
58
20
0
33
44
1.57
116275359--116275439
21
3.8
21
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18
0
40
40
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116275393--116275424
14
2.3
14
100
0
64
15
0
46
37
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14
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1.68
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4.8
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3
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42
4
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1.66
116275889--116275925
18
2.1
18
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0
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2.7
23
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1
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1.12
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20
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1.90
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1.78
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241
1.8
242
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0
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1
28
1.63
116279408--116279466
27
2.2
27
90
0
100
45
23
1
28
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
43
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0
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25
22
26
2.00
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28
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27
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15
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15
50
1.55
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2.1
21
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8
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2
0
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1.13
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2.4
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20
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0
0
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21
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33
33
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0
0
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0
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17
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1.9
83
86
2
225
24
10
16
47
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116335948--116335987
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2.0
21
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55
2
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2.1
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0
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0
0
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0
0
50
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0
0
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0
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1
2
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1.18
116356684--116356784
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0
0
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48
0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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