Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  244  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82537788--82537982
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0
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2.2
120
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422
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20
26
1.99
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1.99
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2.2
13
100
0
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0
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20
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40
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19
19
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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2.6
114
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19
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28
1.97
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20
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20
0
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38
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82604074--82604169
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15
70
27
1
40
31
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0
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207
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4
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45
1.35
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4.1
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50
5
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41
1.41
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2.9
26
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1.44
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2.1
17
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25
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24
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29
19
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1
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30
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2.0
52
90
1
165
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15
0
34
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.61
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2.2
72
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20
2
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12
2.1
12
100
0
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24
32
1.84
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14
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1.94
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10
0
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1
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0
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1.61
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14
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1
60
46
30
1
21
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82624510--82624592
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2
26
1.66
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40
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32
22
21
25
1.98
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2.4
75
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231
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19
19
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217
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17
23
28
1.97
82626264--82626380
42
2.8
41
80
2
108
25
20
22
31
1.98
82626834--82626939
43
2.5
43
87
0
158
32
24
16
26
1.97
82626834--82626966
43
3.1
42
81
6
142
30
25
17
27
1.97
82627016--82627130
42
2.7
43
80
2
142
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26
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28
1.93
82627455--82627612
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3.7
43
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0
208
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13
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1.94
82627610--82627680
24
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21
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38
1
2
57
1.22
82627619--82627681
24
2.8
22
80
15
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34
1
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1.22
82632944--82632975
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15
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52
2
0
45
1.13
82633322--82633363
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15
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52
0
0
47
1.00
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28
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3
0
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1.17
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2.2
21
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1.63
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39
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1.98
82637743--82637963
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5.2
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1.97
82637874--82637958
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2.1
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1.98
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2.0
45
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1.88
82638695--82638723
13
2.1
14
93
6
51
55
10
0
34
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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28
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29
21
1.98
82643561--82643861
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93
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28
20
29
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1.98
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2.0
55
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19
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25
1.98
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3.4
94
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29
19
29
21
1.97
82650855--82651215
141
2.5
143
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369
29
19
29
21
1.98
82650859--82651215
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7.5
47
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13
205
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19
29
21
1.98
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1.97
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2.1
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229
34
0
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1.46
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2.3
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1
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1.61
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0
25
1.57
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2.5
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0
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1.58
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40
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170
25
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21
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1.98
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0
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42
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29
25
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29
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1.9
21
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0
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32
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31
2.4
31
83
0
92
50
15
15
19
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82675880--82676099
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8.2
27
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250
26
20
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1.94
82675877--82676126
81
3.1
80
84
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301
26
19
18
36
1.94
82675907--82676099
80
2.4
81
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2
300
25
19
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1.93
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54
6.7
54
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27
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1.78
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2.5
31
87
0
104
50
12
16
20
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362