Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  250  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84385174--84385350
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10
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26
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27
2.00
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2.0
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1.99
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2.3
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204
23
26
23
26
2.00
84385657--84385735
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2.7
29
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5
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1.95
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0
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1.94
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2.1
37
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28
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4.2
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1.88
84387860--84388253
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47
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607
28
29
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32
1.88
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10
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1.8
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0
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0
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39
2.9
39
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2
158
40
9
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35
1.78
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39
2.8
39
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0
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30
21
15
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1.94
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40
5.6
40
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3
272
24
22
26
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84442868--84443092
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2.8
81
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2
285
24
22
27
26
2.00
84449205--84449388
40
4.6
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9
194
24
21
27
26
1.99
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2.3
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26
1.99
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26
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25
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84512355--84512422
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2.1
32
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29
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35
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2.1
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0
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2.0
21
82
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54
0
11
34
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84522208--84522258
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2.8
18
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3
33
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1.13
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2.2
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84
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27
12
24
1.91
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28
3.9
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1
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18
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20
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375
38
19
10
31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84620900--84621311
27
15.3
27
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18
26
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2.5
31
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0
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20
16
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56
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1.78
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0
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29
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1.97
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48
95
0
174
40
5
15
38
1.70
84648055--84648100
22
2.0
23
87
4
67
52
19
13
15
1.75
84655872--84655981
28
4.0
28
82
4
127
33
20
22
22
1.97
84656090--84656152
26
2.4
26
86
0
81
25
11
28
34
1.90
84659381--84659505
64
2.0
63
85
4
171
50
6
2
40
1.41
84659926--84659965
19
2.1
19
86
9
55
32
2
7
57
1.40
84664967--84665237
135
2.0
135
99
0
533
39
11
15
33
1.83
84665677--84665729
23
2.3
23
86
0
79
33
13
26
26
1.93
84680546--84680588
17
2.6
16
88
3
59
60
2
32
4
1.30
84687909--84687953
22
2.0
22
87
8
65
11
24
20
44
1.83
84688333--84688361
12
2.4
12
100
0
58
44
17
20
17
1.86
84689350--84689404
26
2.2
24
80
6
65
32
18
21
27
1.96
84689530--84689609
19
4.2
19
76
4
81
27
8
22
41
1.83
84689565--84689613
18
2.5
20
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28
12
16
42
1.84
84700325--84700499
46
3.8
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11
178
29
28
21
21
1.99
84700333--84700504
93
1.8
93
89
0
272
28
28
21
21
1.99
84700376--84700519
46
3.1
46
71
18
127
30
28
20
20
1.98
84710554--84710588
18
2.0
17
88
5
52
11
5
5
77
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84713504--84713536
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2.6
13
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4
50
39
0
12
48
1.40
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20
3.2
20
70
8
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22
9
27
40
1.84
84714758--84714842
42
2.0
42
90
0
134
22
7
25
44
1.78
84714775--84714840
20
3.2
20
68
8
51
22
4
28
43
1.73
84721920--84722236
46
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49
73
15
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23
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18
28
1.98
84733782--84733817
18
2.0
18
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0
63
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5
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1.50
84742553--84742603
23
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23
100
0
102
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7
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1.50
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20
2.0
20
100
0
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15
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1.60
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1.9
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20
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1.9
18
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5
52
14
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11
1.82
84795299--84795371
17
4.2
17
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3
110
13
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1.76
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39
2.0
40
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2
119
51
9
14
23
1.72
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27
3.5
27
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5
73
46
10
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25
1.80
84806752--84806809
27
2.1
27
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0
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8
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1.85
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27
2.1
27
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0
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20
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1.97
84806805--84806866
27
2.3
27
91
0
97
29
19
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1.95
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50
4.9
50
85
3
320
23
18
27
30
1.98
84810078--84810360
101
2.8
100
84
1
323
24
17
26
31
1.97
84810082--84810378
151
2.0
153
88
2
447
23
17
26
31
1.97
84813465--84813553
45
1.9
47
86
4
128
25
11
13
49
1.75
84817631--84817688
19
3.4
17
71
28
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62
5
1
31
1.27
84817777--84817801
13
1.9
13
100
0
50
32
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84817772--84817813
18
2.3
18
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0
57
38
0
0
61
0.96
84834122--84834266
40
3.6
39
81
3
157
24
22
28
24
2.00
84842043--84842227
40
4.7
40
82
6
198
24
20
28
27
1.99
84842096--84842250
79
2.0
79
81
7
181
25
18
27
27
1.98
84849811--84849863
29
2.0
27
82
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62
3
1
32
1.24
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3.8
50
84
0
223
35
26
17
20
1.95
84852209--84852395
100
1.9
99
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252
35
26
17
20
1.95
84852208--84852387
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1.95
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2.0
24
83
0
60
18
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1.96
84864753--84864795
20
2.2
20
100
0
86
55
4
0
39
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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