Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  249  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
Size
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Score
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37
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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29
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29
29
1.87
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78
27
18
12
41
1.86
84267125--84267466
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47
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1
551
33
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28
1.86
84267197--84267274
25
3.2
25
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17
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34
5
29
30
1.79
84269417--84269529
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38
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0
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17
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25
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84269865--84269962
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2.3
56
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19
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1.97
84269892--84269989
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28
70
5
99
18
19
34
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1.95
84273045--84273386
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47
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84273117--84273194
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25
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1.79
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3
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0
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46
4.7
47
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1.98
84287212--84287429
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1.98
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24
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1.94
84311432--84311469
19
2.0
20
85
15
53
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23
0
36
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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2.0
21
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42
0
20
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1.52
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1.98
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1.98
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1.99
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1.99
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1.99
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205
25
22
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1.99
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1.98
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28
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1.98
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15
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21
1.98
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1.9
93
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1.98
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0
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20
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2.0
19
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2.3
13
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12
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2.7
47
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125
26
17
28
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84357447--84357722
49
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49
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18
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27
1.98
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14
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1.94
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2.0
56
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22
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1.98
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9.5
47
94
0
701
29
30
8
31
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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