Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  262  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
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2.0
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25
2.0
25
84
7
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40
26
14
20
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
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29
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1.8
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20
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1.99
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2.1
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0
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14
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2.0
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2.0
20
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1.93
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53
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16
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121
100
0
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1.93
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2.7
23
77
13
67
75
0
23
1
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.2
21
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53
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1.51
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2.0
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60
3
7
28
1.41
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1.49
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19.7
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4
5
32
1.41
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5
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1.43
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5
3
30
1.34
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4
5
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1.42
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19
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16
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1.95
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1.92
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77
4.2
76
91
1
494
34
21
16
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88622116--88622440
153
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152
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20
16
27
1.94
88634585--88634631
22
2.2
21
82
14
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53
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6
34
1.52
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26
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60
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5
7
32
1.52
88634798--88634827
14
2.1
14
100
0
60
53
13
6
26
1.64
88634848--88635056
23
8.6
25
77
13
174
56
5
5
33
1.44
88634905--88635037
24
5.3
28
73
21
75
60
6
3
30
1.36
88635157--88635186
15
2.0
15
93
0
51
63
0
3
33
1.11
88638515--88638571
10
5.5
10
75
8
51
35
5
1
57
1.31
88643970--88644097
25
5.1
25
77
11
111
21
29
18
30
1.97
88643991--88644097
50
2.1
50
84
6
137
20
28
20
29
1.98
88644027--88644115
25
3.6
25
80
10
101
21
25
23
29
1.99
88644003--88644109
50
2.1
50
83
6
128
20
28
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28
1.99
88646616--88646800
46
3.9
48
83
6
229
29
17
27
25
1.98
88646616--88646800
94
2.0
93
87
6
266
29
17
27
25
1.98
88646622--88646825
94
2.2
94
84
5
252
29
17
26
25
1.97
88646611--88646825
46
4.6
48
82
5
226
30
17
26
25
1.97
88646616--88646973
46
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11
220
28
17
26
26
1.98
88646886--88647023
49
2.9
48
80
7
138
28
21
26
23
1.99
88658020--88658292
27
10.3
27
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5
317
45
21
15
18
1.86
88658668--88658710
18
2.4
18
100
0
86
23
27
16
32
1.96
88661487--88661815
27
12.2
27
89
0
451
42
22
17
18
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88666566--88666720
42
3.7
41
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6
195
28
25
17
29
1.97
88666566--88666730
84
2.0
84
84
2
215
29
24
16
29
1.96
88673608--88673924
47
6.8
46
74
14
244
25
30
18
25
1.98
88673612--88673924
145
2.2
144
81
10
346
25
30
17
25
1.97
88682640--88682720
6
13.8
6
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3
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18
7
0
74
1.05
88682636--88682731
12
8.0
12
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2
95
18
6
1
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1.09
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13
3.1
13
88
0
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15
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15
1.88
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40
4.6
39
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7
232
25
27
22
24
2.00
88695344--88695528
79
2.3
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7
256
25
27
22
24
2.00
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3.7
40
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26
27
22
23
2.00
88711985--88712108
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2.6
47
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21
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1.95
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46
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28
29
21
21
1.98
88713682--88713812
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2.8
45
76
11
131
29
29
20
21
1.98
88719155--88719325
93
1.8
93
92
0
288
29
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19
20
1.97
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3.8
46
78
14
182
30
29
19
19
1.97
88729047--88729092
17
2.9
16
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56
2
0
41
1.11
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30
2.2
30
79
7
75
52
7
1
38
1.38
88729732--88729778
22
2.2
22
88
3
69
42
2
2
53
1.25
88731988--88732023
3
12.0
3
100
0
72
0
33
0
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0.92
88736439--88736701
47
5.6
46
81
11
240
22
29
19
28
1.98
88736440--88736701
94
2.8
91
79
12
275
22
29
19
28
1.98
88736440--88736701
140
1.9
141
86
5
379
22
29
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88738523--88738589
21
3.2
21
81
10
75
34
7
1
56
1.36
88752543--88753151
94
6.5
93
80
5
593
35
18
19
27
1.95
88752635--88752783
50
3.1
50
70
17
134
36
20
18
24
1.94
88752543--88753131
281
2.1
282
82
4
688
35
18
18
27
1.95
88752507--88753148
188
3.4
188
80
5
726
35
18
19
27
1.95
88753836--88753868
6
5.8
6
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13
52
84
0
0
15
0.61
88753836--88753866
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1.9
16
100
0
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83
0
0
16
0.64
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12
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17
52
84
0
0
15
0.61
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3.2
21
81
10
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34
7
1
56
1.36
88756795--88756865
33
2.1
35
82
10
85
30
19
11
38
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362