Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  215  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72606720--72606822
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0
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1.9
151
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6
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1.82
72606971--72607259
103
2.9
102
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30
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6
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2.1
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28
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16
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27
1.97
72646407--72646562
27
5.7
27
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163
26
16
28
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
72646399--72646583
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2.3
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210
26
16
28
29
1.97
72654483--72654638
82
1.9
81
85
3
215
26
16
28
28
1.97
72654482--72654635
55
2.9
52
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7
175
27
16
27
27
1.97
72654483--72654638
27
5.7
27
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6
163
26
16
28
28
1.97
72654475--72654659
27
6.8
27
75
9
101
26
16
28
29
1.97
72654475--72654659
82
2.3
81
78
2
210
26
16
28
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2.2
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211
23
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25
1.99
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79
2.2
75
76
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168
25
19
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27
1.99
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2.0
45
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1.93
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34
2.6
34
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5
121
34
17
21
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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29
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1.87
72742214--72742745
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3.8
139
95
1
911
28
29
8
32
1.87
72742214--72742745
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186
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29
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1.87
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1.83
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1829
24
21
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72787317--72787510
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26
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1.82
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1.82
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2.8
36
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4
154
24
17
30
27
1.97
72791042--72791131
24
3.7
24
85
7
112
25
32
15
26
1.96
72791066--72791177
24
4.6
24
80
2
107
26
30
16
26
1.96
72791066--72791177
49
2.3
48
83
7
129
26
30
16
26
1.96
72792190--72792228
20
1.9
21
89
5
62
20
7
0
71
1.10
72794755--72794826
36
2.0
36
81
5
83
27
4
31
36
1.76
72794857--72794900
2
21.5
2
90
4
70
2
2
47
47
1.27
72796397--72796455
28
2.1
28
100
0
118
49
3
3
44
1.36
72796529--72796568
15
2.7
15
84
0
53
67
2
15
15
1.34
72796593--72796640
7
6.9
7
97
0
69
64
0
6
29
1.18
72796579--72796703
21
6.0
20
73
14
92
56
0
14
29
1.39
72803189--72803221
10
3.2
11
87
12
52
66
6
0
27
1.15
72803859--72803897
19
2.0
21
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10
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0
5
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1.24
72805921--72805947
6
4.5
6
100
0
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0
0
48
1.00
72809934--72810109
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21
21
28
28
1.98
72809931--72810102
93
1.8
93
94
0
308
21
21
29
27
1.99
72813790--72813983
47
4.1
47
91
0
298
33
10
28
26
1.90
72813819--72813890
22
3.1
22
64
24
58
33
13
29
23
1.93
72813864--72813939
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72813953--72814338
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7.8
48
85
8
542
37
6
24
31
1.82
72813954--72814338
146
2.6
147
91
4
607
37
6
24
30
1.82
72813953--72814338
98
3.9
97
87
6
546
37
6
24
31
1.82
72814484--72814592
37
2.9
37
94
0
182
23
19
30
26
1.98
72815832--72816435
40
15.1
40
91
0
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24
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27
26
1.99
72820526--72820719
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4.1
47
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0
280
33
10
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27
1.90
72820555--72820626
22
3.1
22
64
24
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33
13
29
23
1.93
72820689--72821069
48
7.8
48
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5
604
35
6
26
30
1.83
72820689--72821066
196
1.9
198
92
3
647
35
6
26
30
1.83
72820690--72821071
148
2.6
146
94
3
671
35
6
26
30
1.83
72821218--72821323
37
2.9
37
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0
167
23
18
30
27
1.98
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3.5
43
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135
26
20
26
26
1.99
72824785--72824896
42
2.6
42
80
5
109
27
20
25
26
1.99
72834796--72835108
47
6.6
47
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2
491
28
29
8
33
1.86
72834796--72835108
96
3.3
96
92
2
526
28
29
8
33
1.86
72850992--72851031
19
2.1
19
100
0
80
27
10
25
37
1.88
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40
4.6
40
86
3
219
26
28
20
25
1.99
72860762--72860946
78
2.3
78
82
3
210
26
28
20
24
1.99
72860762--72860984
80
2.8
79
79
6
202
26
28
19
24
1.99
72860917--72860993
40
1.9
41
81
7
95
28
28
19
23
1.98
72868634--72868856
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5.6
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236
26
28
20
24
1.99
72872839--72872918
40
2.0
40
85
4
108
27
20
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72893533--72893586
27
2.0
27
96
0
99
25
3
27
42
1.72
72894491--72894672
49
3.7
48
80
10
199
29
19
26
23
1.98
72894444--72894666
98
2.3
98
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4
272
30
18
27
23
1.98
72899390--72899431
22
1.9
22
95
0
75
38
9
16
35
1.81
72899561--72899617
19
3.0
20
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10
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2.4
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0
70
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22
1.87
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27
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20
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1.95
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54
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1.95
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8
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3
21
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51
1.62
72914511--72914677
43
3.9
43
85
4
194
26
13
24
35
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362