Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  199  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66971387--66971417
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24
1.99
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3.6
40
80
10
152
24
27
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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141
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4.7
49
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28
18
24
1.98
67053883--67054114
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331
28
28
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24
1.98
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2.0
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28
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1.99
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21
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1.99
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21
1.99
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28
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28
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25
1.97
67091729--67091905
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55
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28
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28
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1.97
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27
6.6
27
79
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115
28
28
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67099832--67100009
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204
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28
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26
1.97
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1.9
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215
28
28
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1.97
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84
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98
32
23
18
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67158530--67158754
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48
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19
25
27
1.99
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25
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25
23
16
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1.95
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40
5.1
40
88
1
286
27
27
21
23
1.99
67174051--67174195
27
5.4
27
81
0
155
37
20
18
24
1.94
67184036--67184069
17
1.9
17
88
5
50
58
5
0
35
1.22
67184182--67184264
27
3.1
26
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11
62
56
1
3
38
1.24
67184238--67184282
18
2.4
19
85
3
56
55
0
0
44
0.99
67184642--67184685
21
2.1
21
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31
4
0
63
1.14
67190340--67190379
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22
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67
2
0
30
1.04
67190359--67190392
15
2.3
15
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10
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0
0
35
0.94
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6
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0
0
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0.61
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48
6.0
48
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285
27
16
29
26
1.97
67201912--67202183
96
2.8
96
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4
388
28
16
29
25
1.97
67201895--67202178
144
2.0
144
82
5
351
27
16
29
26
1.97
67205128--67205198
35
2.0
35
97
0
133
28
8
26
36
1.86
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40
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28
26
1.99
67209489--67209643
83
1.9
83
90
0
247
22
21
29
25
1.99
67213229--67213547
48
6.6
48
77
8
301
28
18
27
24
1.98
67213229--67213501
96
2.8
96
83
3
336
28
18
28
24
1.98
67213216--67213494
144
1.9
144
86
4
393
27
17
28
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67213226--67213547
144
2.2
144
81
4
373
28
18
27
24
1.98
67213792--67213826
18
1.9
18
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0
52
31
11
22
34
1.90
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27
2.1
27
90
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18
8
15
56
1.64
67215718--67215752
10
3.4
10
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52
20
11
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1.70
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26
2.1
28
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22
6
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1.61
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3.8
45
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12
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21
19
28
30
1.98
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1.8
93
91
0
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21
20
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1.98
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0
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0
28
28
1.56
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1.97
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2.2
21
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42
2
21
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1.65
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4.8
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22
23
2.00
67247578--67247772
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2.4
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302
25
28
22
23
1.99
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40
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28
27
21
22
1.99
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40
2.7
40
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0
205
29
25
21
23
1.99
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40
4.6
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237
26
26
22
25
2.00
67272379--67272556
40
4.5
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24
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24
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1.99
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40
5.4
40
84
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240
26
28
21
23
1.99
67279954--67280157
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2.5
79
87
3
266
26
28
22
22
1.99
67281536--67281631
49
2.0
49
97
0
183
44
10
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36
1.69
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46
4.5
46
76
10
129
22
28
19
29
1.98
67292977--67293153
94
1.9
92
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257
22
29
19
28
1.98
67310571--67310981
47
8.7
47
94
0
689
28
30
8
32
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67320800--67320933
40
3.3
40
81
4
153
25
16
22
35
1.94
67325667--67325704
20
2.0
20
85
15
53
39
7
15
36
1.77
67325739--67325851
40
2.8
40
88
4
158
23
22
28
25
1.99
67329947--67329990
20
2.2
20
87
0
61
36
13
2
47
1.56
67332448--67332487
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1.9
21
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0
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2
0
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39
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0
201
24
28
18
28
1.98
67340482--67340527
24
2.0
22
83
8
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19
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1.98
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249
25
18
30
24
1.98
67360134--67360350
96
2.3
96
95
0
398
25
19
29
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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