Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  179  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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28
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28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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23
20
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28
1.99
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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25
16
41
1.89
59215509--59215559
23
2.2
22
86
10
75
27
27
11
33
1.92
59225858--59225898
14
3.2
13
83
10
57
36
19
0
43
1.51
59233026--59233148
57
2.1
59
86
5
171
46
5
18
29
1.72
59237098--59237913
421
1.9
419
91
1
1330
29
25
16
28
1.97
59240499--59241044
47
11.6
47
95
0
939
29
29
8
33
1.86
59240549--59240627
25
3.3
25
66
16
76
31
29
5
34
1.79
59250971--59251306
47
7.1
47
95
0
573
31
10
30
28
1.90
59250971--59251350
94
4.0
94
91
0
562
31
10
30
27
1.89
59250972--59251346
47
8.0
47
92
0
309
31
10
30
27
1.90
59251469--59251547
37
2.1
37
88
0
113
25
18
30
25
1.98
59258787--59258930
55
2.6
54
79
4
162
13
25
32
28
1.94
59262616--59262653
14
2.9
13
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11
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57
10
13
18
1.63
59270186--59270246
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1.9
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0
113
18
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27
34
1.95
59270138--59270292
79
2.0
79
92
2
258
22
16
29
31
1.96
59273317--59273381
15
4.4
15
79
9
71
10
15
12
61
1.56
59273316--59273381
30
2.2
29
81
7
80
10
15
13
60
1.59
59276031--59276291
46
5.6
46
76
13
241
23
18
27
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59276080--59276246
47
3.6
47
78
13
184
25
17
28
28
1.97
59276027--59276291
93
2.8
93
90
2
399
23
18
28
29
1.98
59293090--59293244
43
3.6
42
80
9
154
32
29
16
21
1.95
59299513--59299685
43
4.0
43
72
12
149
32
24
18
24
1.97
59304642--59304763
55
2.2
55
98
0
235
17
22
18
41
1.90
59304642--59304791
55
2.7
55
89
0
156
18
22
18
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1.90
59306521--59306583
32
2.0
32
90
0
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26
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12
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1.80
59311542--59311634
6
16.2
6
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3
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17
0
1
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0.75
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2.1
29
100
0
120
10
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16
66
1.41
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40
5.5
40
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3
271
25
27
23
23
2.00
59331147--59331353
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3.8
54
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1
209
19
25
17
37
1.94
59346069--59346179
57
2.0
57
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5
145
26
30
15
27
1.96
59346066--59346177
28
4.0
29
83
4
131
26
30
15
27
1.96
59347602--59347657
28
2.0
28
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0
103
39
28
5
26
1.78
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26
2.1
25
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22
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1
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1.35
59352990--59353194
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236
22
25
17
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1.95
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22
2.5
21
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11
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23
1
0
75
0.91
59355977--59356134
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20
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22
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27
2
0
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59356101--59356134
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0
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14
0
0
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0.60
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2.4
24
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28
0
0
71
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18
1.9
18
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28
0
11
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1.32
59356225--59356323
3
34.7
3
78
18
79
23
2
3
71
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59369050--59369177
42
2.8
44
85
10
145
39
23
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22
1.91
59371712--59371859
39
3.8
39
92
0
224
27
19
21
31
1.98
59373539--59373769
40
5.8
40
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0
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25
22
27
24
1.99
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80
3.2
80
90
3
403
26
23
28
22
1.99
59381620--59381852
40
5.9
40
95
0
407
26
22
28
23
1.99
59381620--59381879
40
6.6
40
92
2
357
26
23
27
22
1.99
59389679--59389940
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3.3
80
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1
384
26
23
27
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2.00
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0
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1.99
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4.1
39
90
0
237
27
20
23
28
1.99
59405083--59405365
48
5.9
48
78
6
252
28
19
26
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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