Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  359  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118573833--118574184
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0
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70
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26
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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118647032--118647083
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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96
0
93
35
17
19
27
1.94
118795974--118796286
166
1.9
166
88
1
475
47
16
12
23
1.81
118799567--118799617
25
2.1
25
85
10
70
35
0
0
64
0.94
118801093--118801180
21
4.3
20
78
12
83
71
2
21
4
1.15
118804245--118804292
18
2.6
19
76
6
62
47
0
0
52
1.00
118808101--118809395
436
3.0
432
87
2
1745
38
14
13
33
1.85
118809612--118809733
64
1.9
64
83
5
158
45
17
7
30
1.75
118812960--118813021
30
2.1
30
87
0
88
59
8
3
29
1.42
118817993--118818122
42
3.1
42
83
9
158
14
21
20
43
1.88
118820059--118820108
18
2.8
18
78
0
55
42
22
8
28
1.81
118823444--118823676
120
2.0
118
88
3
351
45
6
8
40
1.58
118827089--118827154
32
2.0
33
91
2
107
30
19
10
39
1.86
118834503--118834538
7
5.1
7
100
0
72
13
0
0
86
0.58
118834502--118834548
21
2.2
21
80
0
58
17
0
6
76
0.98
118834659--118834717
23
2.6
21
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15
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49
1
1
47
1.21
118834832--118834912
40
2.0
40
95
4
146
37
17
9
35
1.83
118836295--118836405
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
118840928--118840979
16
3.3
15
76
10
50
23
1
17
57
1.49
118843372--118843412
10
4.1
10
84
9
57
73
7
0
19
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118843372--118843425
20
2.5
22
85
11
67
72
5
0
22
1.05
118848058--118848370
155
2.0
155
98
0
599
33
18
7
39
1.80
118849640--118849679
22
1.9
20
90
10
62
50
0
2
47
1.14
118854415--118854450
16
2.2
16
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0
54
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0
2
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1.14
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19
2.2
19
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0
55
43
0
2
53
1.13
118864567--118864595
14
2.0
15
93
6
51
31
0
0
68
0.89
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1.9
26
100
0
100
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8
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51
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1.40
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1.9
23
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0
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2
59
1.23
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21
2.7
20
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5
65
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1
5
23
1.19
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3
14.0
3
100
0
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0
0
33
0.92
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26
2.2
25
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6
69
49
0
0
50
1.00
118889275--118889329
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3.6
15
74
18
51
34
1
1
61
1.17
118890223--118890307
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2.3
36
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6
109
7
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91
2.3
91
88
0
308
46
3
4
46
1.39
118893448--118893592
44
3.2
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116
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2
3
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1.31
118893445--118893585
47
3.1
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20
114
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2
3
48
1.31
118893532--118893592
28
2.2
28
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5
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45
0
3
50
1.17
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0
2
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1.13
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15
2.9
15
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10
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0
0
52
1.00
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0
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0
26
1.57
118896005--118896038
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118900644--118900677
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
118902234--118902280
21
2.2
21
81
7
51
31
0
4
63
1.13
118912922--118912970
23
2.1
23
81
11
55
42
0
8
48
1.32
118918100--118918142
22
2.0
22
95
0
77
34
9
11
44
1.73
118918649--118919103
103
4.5
101
73
11
333
45
10
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26
1.80
118927270--118927356
26
3.3
26
70
20
74
36
1
2
59
1.17
118940001--118940060
18
3.4
17
81
11
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5
1
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1.25
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7
2
60
1.39
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29.0
1
100
0
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100
0
0
0
0.00
118952620--118952902
41
6.6
41
72
13
142
30
20
20
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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