Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16423435--16423471
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2.1
18
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0
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1.96
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2.0
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100
0
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29
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1.97
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2.0
96
96
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1.97
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1.8
135
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428
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22
29
29
1.97
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26
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1.99
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25
27
21
25
1.99
16442358--16442541
40
4.7
40
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243
25
27
22
24
2.00
16442358--16442541
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2.3
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22
24
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2.8
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1
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24
16
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31
1.97
16446195--16446312
42
2.8
42
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24
16
27
31
1.97
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28
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1.8
93
89
0
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22
21
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2.0
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0
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16
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3.3
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20
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43
1.81
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10
30
1.87
16506801--16506929
54
2.4
54
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2
170
39
19
11
29
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.80
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26
3.1
27
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14
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15
6
36
1.74
16507112--16507176
27
2.4
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21
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1.99
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16
26
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1.97
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4.1
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1.90
16520979--16521143
27
6.1
27
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131
31
13
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1.90
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2
203
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15
28
29
1.96
16527906--16528082
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225
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1.96
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1.9
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231
27
15
28
29
1.96
16527903--16528082
81
2.2
81
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227
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1
199
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14
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1.95
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3.3
54
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232
26
14
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30
1.95
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3.8
37
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3.2
48
88
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223
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16542184--16542229
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1.9
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2
34
1.67
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2.0
72
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0
257
33
23
5
38
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16542208--16542321
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48
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0
201
32
23
5
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1.77
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120
1.9
120
91
0
373
33
23
6
37
1.80
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2.8
37
92
0
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32
18
23
1.97
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2
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26
5
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2.3
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17
23
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1.96
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21
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1.99
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22
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1.99
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29
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1.97
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21
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27
1.99
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2.9
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22
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1.99
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28
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47
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169
28
19
22
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16600263--16600325
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9
26
26
1.87
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4.4
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4
55
53
3
15
28
1.57
16624900--16625008
26
4.2
26
91
0
173
35
23
7
33
1.83
16632021--16632128
26
4.2
26
96
0
198
36
25
8
30
1.85
16633419--16634638
611
2.0
613
97
0
2282
35
19
9
35
1.85
16636524--16636845
161
2.0
161
96
0
590
31
17
16
34
1.92
16640407--16640448
22
1.9
22
85
0
57
11
4
23
59
1.51
16641521--16641614
48
2.0
48
87
8
138
40
27
12
19
1.88
16644034--16644127
48
2.0
48
85
8
129
41
27
11
19
1.86
16649443--16649480
8
4.6
8
93
6
67
13
0
0
86
0.56
16649443--16649479
17
2.2
17
100
0
74
10
0
0
89
0.49
16650019--16650103
44
1.9
44
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4
127
37
28
10
23
1.88
16665150--16665273
35
3.5
35
86
1
149
26
12
19
41
1.88
16670811--16670841
16
2.0
15
93
6
53
83
0
0
16
0.64
16672111--16672140
3
10.0
3
92
0
51
63
0
3
33
1.11
16673031--16673067
20
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19
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10
58
8
43
24
24
1.81
16674669--16674777
37
2.9
37
93
0
173
27
30
18
23
1.98
16674927--16675110
50
3.7
50
90
4
277
30
25
7
36
1.84
16675081--16675226
47
3.1
47
85
0
166
28
30
9
32
1.89
16675251--16675305
23
2.4
25
76
17
73
30
27
5
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16694158--16694438
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2.0
138
95
4
503
36
14
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29
1.91
16699826--16700092
46
5.7
46
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11
170
24
28
19
26
1.99
16700392--16700451
30
2.0
30
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77
33
23
13
30
1.93
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37
2.0
37
94
0
130
27
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25
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1.87
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2.0
42
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1.96
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15
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1.95
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2.0
22
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1.98
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25
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0
102
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24
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0
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1.32
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2.0
23
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45
10
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23
2.0
23
82
8
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40
13
8
37
1.76
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48
5.1
48
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3
415
35
6
26
31
1.82
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98
2.5
98
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413
35
6
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1.82
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37
2.9
37
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0
191
22
19
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1.98
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0
0
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21
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23
0
0
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0.79
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18
2
0
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12
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85
0
2
12
0.70
16748506--16748560
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2.4
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17
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78
0
9
12
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20
16
31
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43
2.7
43
79
10
133
33
16
22
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16778080--16778104
13
1.9
13
100
0
50
32
4
24
40
1.73
16782659--16782705
25
1.9
24
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4
67
70
4
14
10
1.31
16783651--16783761
38
2.8
40
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26
28
1.99
16783650--16783775
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3.2
39
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25
19
25
29
1.99
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2.3
18
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48
0
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0
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4.3
6
100
0
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0
0
15
0.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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