Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  307  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103001546--103001598
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18
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0
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0
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52
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0
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52
0
0
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2
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5.0
23
69
19
79
64
2
1
31
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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1.91
103037821--103038094
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3.0
92
89
0
404
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20
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0
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103044237--103044270
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86
8
52
0
17
0
82
0.67
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1.9
150
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46
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1.99
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2.3
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26
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198
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33
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0
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2.0
25
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0
93
21
37
11
29
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
23
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0
100
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24
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1.78
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2.2
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11
0
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2.4
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19
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1
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1.18
103130078--103130149
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11
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1
34
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.97
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6
18
18
1.62
103146613--103146769
39
4.0
39
92
0
251
28
20
28
23
1.99
103148744--103148783
9
4.4
9
93
0
71
42
22
10
25
1.84
103148791--103148847
17
3.2
17
67
13
51
50
15
1
31
1.54
103148782--103148893
37
3.0
37
92
0
188
44
16
6
32
1.73
103151639--103151841
56
3.7
55
77
8
200
46
16
8
28
1.77
103151682--103151838
53
2.9
53
81
6
181
46
17
9
26
1.79
103157599--103157636
19
2.0
19
94
0
67
23
15
10
50
1.75
103159283--103159333
27
2.0
25
88
7
75
23
25
17
33
1.96
103161811--103161949
47
2.9
47
87
4
190
22
21
21
34
1.97
103161801--103161971
23
7.2
23
76
10
150
22
21
20
35
1.96
103162501--103162866
182
2.0
182
99
0
723
28
5
22
43
1.75
103168493--103168722
46
5.0
46
85
0
289
30
24
16
29
1.96
103168481--103168748
92
2.9
92
81
0
329
31
23
15
29
1.95
103168492--103168748
138
1.9
138
81
0
316
31
24
15
28
1.95
103169086--103169440
5
71.6
5
98
1
689
60
0
0
40
0.97
103170756--103170818
23
2.8
22
82
4
81
39
15
12
31
1.85
103170777--103170843
23
2.9
24
80
8
84
44
11
11
31
1.78
103174332--103174477
72
2.0
72
93
0
247
27
26
16
29
1.97
103176344--103176382
21
1.9
20
84
5
51
64
20
7
7
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103180961--103181002
11
3.8
11
85
14
52
45
0
7
47
1.30
103183608--103183736
46
2.8
46
95
0
222
19
21
29
29
1.98
103188313--103188373
21
3.2
21
60
26
53
36
16
14
32
1.89
103203281--103203418
18
7.9
18
78
14
148
37
15
12
34
1.85
103203293--103203418
35
3.7
34
80
15
145
38
15
11
34
1.85
103203824--103204809
207
4.8
207
93
0
1589
30
22
17
29
1.97
103204815--103205016
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2.4
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86
8
264
21
21
24
32
1.98
103205965--103206028
21
3.2
19
78
20
60
1
12
3
82
0.85
103205980--103206028
21
2.4
20
90
6
80
2
10
4
83
0.85
103208831--103209008
39
4.6
39
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6
211
29
25
20
23
1.99
103210561--103210590
16
1.9
15
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51
23
20
0
56
1.42
103211532--103211591
18
3.3
18
90
2
84
38
16
10
35
1.82
103211522--103211599
18
4.3
18
83
6
70
38
12
12
35
1.82
103212668--103212776
18
5.9
19
88
8
172
36
15
11
36
1.83
103212668--103212776
35
3.0
36
91
6
175
36
15
11
36
1.83
103213156--103213668
207
2.5
206
88
1
767
29
23
17
29
1.97
103213787--103214077
83
3.4
84
83
5
390
23
20
21
33
1.97
103215032--103215064
16
2.1
16
94
5
59
6
9
0
84
0.76
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16
2.4
15
87
12
58
7
7
0
84
0.79
103215025--103215080
21
2.7
21
86
10
71
5
10
1
82
0.91
103220827--103220940
17
6.3
18
88
5
169
36
15
10
36
1.82
103220818--103220932
35
3.2
35
95
3
194
37
13
12
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103223597--103223636
14
2.9
14
88
0
53
52
37
2
7
1.43
103224089--103224221
42
3.2
41
80
9
112
42
17
21
18
1.89
103224175--103224251
20
3.8
20
79
5
73
40
15
18
25
1.90
103224163--103224246
21
4.1
21
76
10
68
41
15
19
23
1.89
103224120--103224239
42
2.9
41
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7
136
40
16
20
21
1.91
103225254--103225333
38
2.1
38
95
0
142
28
18
27
25
1.98
103226417--103226570
77
2.0
77
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0
290
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8
12
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2.0
31
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49
19
9
21
1.77
103229432--103229553
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52
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203
27
13
8
50
1.71
103229900--103229939
16
2.4
16
91
4
62
55
0
0
45
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362