Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  261  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
35
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
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1.99
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15
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2.8
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76
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26
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23
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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50
29
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20
1.49
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18
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43
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0
136
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19
33
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
19
34
1.94
88295075--88295105
14
2.2
14
94
0
53
12
6
16
64
1.47
88296366--88296451
44
2.0
43
90
6
138
30
12
12
44
1.80
88296505--88296554
22
2.2
22
92
3
82
36
24
8
32
1.84
88319111--88319193
41
2.0
41
92
0
139
42
25
7
25
1.80
88321764--88321939
94
1.9
92
86
2
253
36
19
7
36
1.80
88321986--88322040
18
3.0
18
84
7
58
54
0
1
43
1.10
88322049--88322099
10
5.3
10
75
15
54
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1
1
29
1.13
88322221--88322406
9
21.1
9
63
18
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2
2
62
1.21
88322252--88322312
19
3.4
19
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13
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31
3
3
62
1.27
88322252--88322342
35
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32
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17
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30
2
2
64
1.17
88322293--88322339
24
2.0
23
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0
2
63
1.06
88322270--88322368
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1.9
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1.10
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0
0
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0.96
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30
1.80
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2.2
35
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2
109
27
3
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59
1.46
88333748--88333788
21
2.0
21
100
0
82
19
14
36
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
100
0
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19
14
14
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21
1.9
22
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14
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34
2
26
36
1.70
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48
3.0
48
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0
223
29
20
24
25
1.99
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34
2.1
34
97
0
133
23
30
8
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1.85
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21
2.0
22
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4
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2
0
35
1.09
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2.1
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0
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31
1.90
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62
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0
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0
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0
0
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0.91
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1
0
36
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1.79
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5
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17
0
0
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0
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0
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46
0
13
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19
2.3
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18
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1.52
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2.3
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29
15
28
26
1.96
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50
2.1
50
83
3
129
30
22
22
25
1.99
88396127--88396276
25
6.0
25
72
18
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33
20
21
24
1.97
88402779--88402855
22
3.4
22
69
22
68
35
14
27
23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88402752--88402943
47
4.1
47
89
1
278
35
11
27
25
1.90
88402779--88402900
22
5.3
22
63
30
58
35
13
27
24
1.92
88402917--88403007
46
2.0
46
88
0
137
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7
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27
1.85
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40
10.3
40
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0
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23
22
29
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1.99
88404841--88404947
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23
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1.99
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1.9
57
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0
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0
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22
22
22
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10
4.0
10
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0
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57
0
0
42
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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