Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  283  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95391930--95392046
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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4.6
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1.98
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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14
1.76
95514534--95514590
28
2.0
28
96
0
105
42
17
12
28
1.85
95518526--95518589
31
2.0
34
84
9
89
51
4
3
40
1.38
95518526--95518595
32
2.2
30
82
10
77
51
4
2
41
1.36
95532682--95532752
35
2.0
35
91
0
115
36
19
9
33
1.85
95534862--95534978
59
2.0
59
91
0
189
52
7
4
35
1.49
95535354--95535395
18
2.3
18
83
0
57
42
9
21
26
1.83
95536068--95536128
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1.9
32
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3
97
67
1
3
27
1.16
95539946--95539995
19
2.5
19
83
6
55
40
0
6
54
1.25
95554863--95554900
17
2.2
18
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13
28
47
10
1.76
95576314--95576339
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
95582701--95582755
27
2.0
27
100
0
110
21
23
3
50
1.64
95583821--95583913
43
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44
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3
154
51
13
6
27
1.66
95588558--95588650
43
2.2
44
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3
154
51
13
5
29
1.63
95592622--95592692
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21
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21
14
1.71
95592619--95592704
44
2.0
44
97
0
163
52
15
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12
1.74
95596563--95596638
38
2.0
38
94
0
134
26
26
13
34
1.93
95596529--95596751
114
2.0
114
92
1
376
28
26
11
33
1.91
95596791--95596841
22
2.3
22
96
0
93
47
0
5
47
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95601591--95601628
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2.7
15
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12
62
0
10
0
89
0.49
95601593--95601628
18
1.9
19
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5
65
0
11
0
88
0.50
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9
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12
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1
2
28
1.14
95602037--95602086
10
5.3
10
74
11
52
70
2
4
24
1.15
95602037--95602088
18
2.8
18
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1
3
26
1.18
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0
0
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0
1
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19
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10
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34
2
1
61
1.18
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19
4.9
19
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15
72
31
4
2
61
1.26
95603393--95603520
60
2.1
61
84
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167
30
3
3
63
1.25
95611061--95611106
18
2.6
18
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3
58
19
30
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13
1.90
95612166--95612220
28
2.0
28
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0
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50
7
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1.64
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2
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3
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3
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0
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26
26
22
24
2.00
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40
4.7
40
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225
25
27
22
24
2.00
95629320--95629504
79
2.3
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83
7
229
25
27
22
24
2.00
95632704--95632762
26
2.3
25
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62
5
5
27
1.37
95644760--95644816
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3.5
15
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15
53
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10
15
35
1.82
95644760--95644838
36
2.1
38
90
9
126
37
10
16
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95644760--95644838
19
4.2
19
90
9
126
37
10
16
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1.82
95646587--95646650
35
1.9
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87
9
96
46
6
1
45
1.37
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1.9
21
89
0
62
62
0
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1.17
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40
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1
141
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22
22
20
1.97
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2.5
40
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21
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330
92
0
1262
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19
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195
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19
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1
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1.58
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22
2.3
25
78
9
60
22
0
33
44
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362