Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  311  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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278
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20
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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18
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6
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1.14
104034297--104034347
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2.1
24
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12
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1.9
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32
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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1
17
57
1.49
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2.0
71
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2
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2.0
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24
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7
32
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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73
17
22
34
25
1.96
104135532--104135575
22
2.0
23
81
4
54
50
11
6
31
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104138242--104138280
20
2.0
19
95
5
69
46
5
7
41
1.55
104138386--104138425
18
2.2
18
95
0
71
25
17
7
50
1.72
104147365--104147400
18
2.0
18
88
0
54
33
2
11
52
1.51
104147442--104147479
17
2.1
19
85
9
53
21
5
0
73
1.02
104147442--104147529
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2
2
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104147449--104147535
29
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29
2
2
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1.17
104148478--104148552
27
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22
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104153201--104153238
3
12.7
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100
0
76
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0
0
68
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27
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4
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0
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0
9
16
1.07
104163401--104163427
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2.1
13
100
0
54
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37
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6
10.0
6
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0
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104168566--104168625
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18
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0
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40
21
1.75
104169264--104169300
14
2.6
14
91
0
56
37
5
21
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1.77
104171304--104171342
19
2.1
18
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2
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2
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104175250--104175298
25
2.0
25
84
4
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63
8
0
28
1.23
104175262--104175307
25
1.9
23
86
8
65
63
8
0
28
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
72
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2
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16
23
1.96
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104
2.2
103
92
2
367
31
31
18
17
1.95
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49
2.2
52
90
7
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28
2.0
28
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2.2
21
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0
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15
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2.0
26
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0
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29
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23
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1.90
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2.2
104
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2
369
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31
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1.95
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28
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1.9
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24
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1.95
104196751--104196942
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7.8
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20
25
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0
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0
0
1.00
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27
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1.81
104211225--104211327
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2.0
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0
170
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9
17
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1.82
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0
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0
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0
0
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20
2.0
20
100
0
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36
29
14
19
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104223102--104223126
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2.8
9
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0
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20
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0
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1.43
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20
2.1
20
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4
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0
4
34
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2.4
25
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14
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29
6
0
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104225283--104225329
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2.3
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10
0
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1.90
104232229--104232393
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2.3
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197
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1.97
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2.8
31
91
3
140
22
29
20
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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