Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  299  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100463917--100464173
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
Entropy
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23
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1.98
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1.98
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258
24
28
18
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1.98
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2.2
140
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331
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28
19
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1.98
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1.9
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0
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.49
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1
15
43
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100631111--100631190
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1.31
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2.0
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12
24
28
1.91
100636854--100636892
20
2.0
20
89
0
60
48
2
12
35
1.55
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25
2.0
24
84
8
62
26
24
16
32
1.96
100649954--100650054
51
2.0
51
98
0
193
40
3
27
27
1.74
100651519--100651569
26
2.0
26
96
0
93
25
15
35
23
1.94
100658516--100658571
24
2.4
24
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3
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17
28
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30
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100660466--100660598
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11
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100667685--100667761
40
2.0
38
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7
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25
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100675149--100675193
22
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21
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73
0
26
0
0.84
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1
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28
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15
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5
18
1.75
100677557--100677587
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12
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3
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50
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46
3.8
46
77
14
200
20
20
30
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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93
2
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20
20
30
27
1.98
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20
2.3
19
81
7
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24
15
31
28
1.96
100693767--100693804
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1.9
20
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0
58
26
15
28
28
1.96
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60
2.3
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1.98
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1.8
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1.98
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21
1.98
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23
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1
0
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0
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100742324--100742392
29
2.4
29
95
0
120
31
23
21
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100744249--100744327
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2.0
39
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0
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37
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22
1.92
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2.0
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0
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100756174--100756211
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0
0
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0
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5
21
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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