Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  294  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98812461--98812501
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2
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2
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0
50
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0
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0.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98885938--98886154
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20
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1.9
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19
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1.96
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1.9
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46
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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21
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33
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1.51
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3.6
8
100
0
58
24
13
27
34
1.93
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2.1
43
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0
169
31
13
8
46
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98982679--98982733
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336
25
22
23
28
2.00
99006177--99006417
43
5.6
43
84
2
261
30
26
18
24
1.98
99006205--99006439
129
1.8
129
84
1
319
32
26
17
23
1.97
99007198--99007240
14
3.1
14
90
3
70
53
13
0
32
1.41
99013413--99013449
19
1.9
19
100
0
74
16
45
16
21
1.84
99017851--99017886
18
1.9
19
88
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56
50
0
5
44
1.25
99036664--99036711
22
2.0
22
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18
53
43
2
6
47
1.40
99036688--99036799
57
1.9
58
91
5
183
53
1
0
43
1.17
99038370--99038432
30
2.1
30
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0
108
26
4
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58
1.49
99038555--99038588
11
2.8
12
91
8
52
76
0
0
23
0.79
99045475--99045517
22
2.0
22
85
0
59
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11
4
18
1.42
99045516--99045556
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1.9
22
90
5
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58
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7
1.58
99049732--99049775
17
2.6
17
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50
0
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1.22
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0
17
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1.50
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23
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0
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20
1.94
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42
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17
140
25
18
25
30
1.98
99057935--99058157
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4.8
46
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1
322
20
25
15
39
1.91
99062057--99062181
47
2.7
46
81
7
148
22
18
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
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9
1.23
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19
4.4
19
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73
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3
1
32
1.20
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2.8
29
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62
3
1
32
1.20
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38
2.1
38
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0
138
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18
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0
0
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1.08
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0
0
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0
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2
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14
5.0
15
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44
14
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33
1.74
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2.0
20
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0
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1.70
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2.1
19
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1
3
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1.11
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19
2.3
18
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17
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22
2
2
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1.07
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19
2.0
19
100
0
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0
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99117347--99117511
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13
144
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16
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33
1.96
99120022--99120081
25
2.4
25
85
0
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15
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25
2.0
25
83
0
62
38
0
16
44
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99123646--99123688
16
2.6
17
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17
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0
13
41
1.44
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27
2.2
26
90
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87
39
3
7
50
1.47
99130614--99130654
21
2.0
21
85
0
55
39
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2.0
31
100
0
124
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12
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15
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0
50
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5
8
0.93
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5
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0
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99150691--99150734
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171
22
24
21
31
1.98
99151431--99151659
40
5.5
39
64
20
108
18
22
20
37
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362