Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  306  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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22
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23
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2.0
628
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19
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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18
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2.7
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15
31
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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102897122--102897170
25
2.0
25
88
8
73
0
24
2
73
0.94
102897127--102897176
21
2.4
21
83
6
57
2
24
2
72
1.06
102897123--102897176
25
2.2
25
83
9
67
1
24
1
72
1.05
102897231--102897263
5
6.6
5
100
0
66
60
0
0
39
0.97
102907039--102907136
19
5.2
19
90
7
155
37
9
17
35
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102907029--102907136
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103
37
9
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102908835--102908882
24
2.0
24
100
0
96
37
12
16
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102915267--102915292
11
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11
100
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23
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102916813--102916847
17
2.0
18
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5
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17
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25
17
1.90
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21
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0
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0
38
22
1.54
102920335--102920363
7
4.1
7
100
0
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0
27
27
1.54
102920306--102920375
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2
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102929128--102929256
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2.2
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14
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1
1
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102929183--102929251
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1
40
1.17
102932423--102932632
7
29.1
7
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25
50
33
4
2
60
1.29
102932422--102932576
24
6.0
24
69
17
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3
3
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1.27
102932417--102932524
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2.8
40
80
16
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31
3
1
62
1.23
102932425--102932630
16
12.2
17
68
26
72
33
4
2
60
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102932539--102932594
28
2.0
28
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37
3
3
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1.35
102932491--102932632
13
10.7
13
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33
4
2
59
1.28
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27
3.5
28
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2
126
26
12
28
32
1.92
102938475--102938557
27
3.0
27
85
5
87
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10
25
33
1.90
102938447--102938558
28
4.0
27
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6
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28
11
25
33
1.91
102940225--102940303
27
3.0
25
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7
88
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5
6
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102940239--102940303
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2.4
27
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0
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6
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2
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1.98
102953650--102953966
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314
29
20
28
22
1.98
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2.0
13
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0
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1
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27
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1.99
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0
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2
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1.96
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2.0
58
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2.0
23
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0
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30
8
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19
2.0
20
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2
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1.02
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102986980--102987033
26
2.1
26
100
0
108
24
11
14
50
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102992156--102992271
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2.6
44
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0
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27
30
17
25
1.97
102992266--102992368
47
2.2
47
94
0
179
23
24
22
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1.99
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2.8
16
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38
50
0
11
1.39
102995404--102995447
8
5.5
8
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38
50
0
11
1.39
102995434--102995469
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30
0
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0
0
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0
0
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44
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0
178
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13
46
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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