Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  24  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6993847--6993885
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3.9
205
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6995180--6995934
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1.9
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1228
29
22
18
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0
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16
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7
31
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7022469--7022500
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16
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21
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16
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7022853--7022885
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0
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2.0
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2.0
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66
2.1
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2.1
22
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0
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16
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2
24
1.18
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2.0
33
83
13
86
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2
2
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7098606--7098639
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2.4
14
90
0
50
35
2
11
50
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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22
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0
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2.0
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4
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3.8
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10
11
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1.9
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1.95
7138865--7139034
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28
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13
50
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7159263--7159316
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0
0
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0
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40
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129
25
17
26
29
1.97
7173980--7174076
17
5.5
17
85
7
131
39
12
11
37
1.79
7173972--7174078
35
3.0
35
93
4
178
40
11
12
36
1.78
7173980--7174076
18
5.4
18
87
4
144
39
12
11
37
1.79
7173964--7174077
52
2.2
53
83
10
144
39
12
11
36
1.79
7174387--7174420
12
2.9
12
95
4
61
38
0
0
61
0.96
7174388--7174496
21
5.3
21
70
20
72
37
2
0
58
1.19
7174597--7174667
25
2.8
24
77
12
72
36
1
4
57
1.27
7174876--7174916
3
13.3
3
94
5
73
34
0
0
65
0.93
7175913--7175995
36
2.3
36
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53
18
1
27
1.52
7175956--7176054
21
4.5
21
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13
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52
23
1
23
1.53
7179645--7179699
15
3.7
15
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22
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45
0
0
54
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7179643--7179708
29
2.3
29
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5
107
43
0
0
56
0.99
7179622--7179681
20
3.0
20
70
4
59
40
0
3
56
1.16
7179975--7180179
9
23.9
9
79
10
198
44
21
0
32
1.56
7179987--7180032
22
2.1
22
100
0
92
41
28
0
30
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7183591--7183617
12
2.2
12
100
0
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7
25
33
1.84
7187369--7187430
21
3.0
21
92
0
97
25
19
51
3
1.62
7187794--7187994
43
4.7
43
89
0
294
28
30
16
23
1.97
7187794--7187994
86
2.3
86
93
0
330
28
30
16
23
1.97
7189415--7189442
13
2.2
13
100
0
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0
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1.50
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1.9
21
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77
2
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10
1.08
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0
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0
0
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1.00
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0
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0
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34
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34
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2
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23
14
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35
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34
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0
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23
14
28
33
1.94
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18
2.1
18
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14
51
62
8
2
27
1.37
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17
2.5
16
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50
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2
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1.41
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11
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66
0
0
33
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13
1.9
13
100
0
50
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4
0
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1.02
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2.0
25
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0
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28
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28
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105
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28
1.69
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34
13
24
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1.93
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28
2.3
28
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0
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23
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4.3
7
100
0
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0
0
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3.8
13
77
15
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35
0
1
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1.06
7279743--7279786
22
2.0
21
83
12
54
54
0
15
29
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7279862--7280085
112
2.0
112
100
0
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4
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7284430--7284461
15
2.1
15
94
0
55
9
12
0
78
0.97
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50
3.5
50
90
3
275
33
16
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25
1.96
7285648--7285796
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4.8
31
90
0
217
28
19
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26
1.99
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2.7
46
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5
131
27
14
26
31
1.95
7285865--7286024
42
3.7
42
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30
15
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26
1.96
7285910--7286022
42
2.7
43
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30
15
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26
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7
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15
1
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7290800--7290862
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20
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13
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15
1
1
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0.86
7290806--7290861
4
13.8
4
78
17
53
16
1
1
80
0.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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