Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  34  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9989044--9989350
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4
24
36
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10047414--10047472
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2.0
65
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5
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12
4
36
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
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21
28
28
1.99
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1.99
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18
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0
69
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0
38
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10158893--10158931
13
2.9
14
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55
58
2
0
38
1.12
10159055--10159095
5
7.8
5
84
10
55
63
0
0
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0.95
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0
0
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0
0
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22
24
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1.96
10162271--10162409
27
5.2
26
84
10
183
34
24
23
17
1.96
10162515--10162577
26
2.3
26
83
5
72
30
11
25
33
1.90
10169232--10169389
27
5.9
27
83
11
191
34
22
24
18
1.96
10169250--10169389
54
2.6
54
94
2
246
35
24
23
17
1.95
10171143--10171167
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
10171262--10171380
3
39.3
3
74
17
104
63
1
5
30
1.26
10171302--10171376
20
3.8
20
85
1
107
65
0
2
32
1.07
10172492--10172526
18
1.9
18
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0
52
8
5
37
48
1.58
10174155--10174298
43
3.4
42
77
12
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25
16
25
33
1.96
10174207--10174298
42
2.2
43
88
5
134
27
17
23
31
1.97
10174230--10174310
43
1.9
42
85
7
110
25
17
24
32
1.97
10181091--10181269
86
2.1
85
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1
286
18
25
35
20
1.96
10184946--10184973
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7
100
0
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14
28
0
57
1.38
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13
4.9
13
79
5
76
37
26
6
29
1.81
10187392--10187457
26
2.5
26
82
0
96
36
25
6
31
1.81
10188701--10188787
43
2.0
43
95
0
156
42
12
12
32
1.81
10191734--10191786
26
2.0
26
100
0
106
35
7
7
49
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10199563--10199607
23
2.0
23
82
8
56
37
8
13
40
1.76
10208781--10209101
46
7.0
46
90
0
417
21
24
14
39
1.91
10211241--10211277
20
1.9
20
88
5
58
51
8
0
40
1.32
10212860--10212893
16
2.1
16
89
10
52
17
0
0
82
0.67
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52
2.9
52
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8
188
35
16
25
22
1.94
10223207--10223271
31
2.1
32
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2
87
27
3
10
58
1.47
10223486--10223534
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2.4
20
77
12
55
69
2
0
28
1.00
10223852--10223889
3
12.7
3
100
0
76
0
34
0
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0.93
10230460--10230511
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2.2
24
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0
68
40
3
1
53
1.30
10237745--10237831
44
2.0
44
82
17
110
31
18
27
22
1.97
10238984--10239033
21
2.4
21
93
0
82
16
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30
24
1.96
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24
3.7
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4
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40
15
20
24
1.91
10240438--10240483
24
1.9
24
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0
65
43
17
17
21
1.88
10241370--10241476
53
2.0
52
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1
196
42
14
20
23
1.88
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21
2.1
21
86
0
61
38
2
18
40
1.63
10242488--10242606
25
4.8
25
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107
21
28
19
31
1.97
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13
2.0
13
100
0
52
15
7
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46
1.74
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30
4.4
30
85
0
167
27
46
3
22
1.69
10246809--10246853
20
2.2
20
84
7
56
35
4
0
60
1.17
10246847--10246933
24
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25
80
7
83
35
4
4
55
1.41
10246806--10246935
24
5.7
22
69
19
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34
4
3
57
1.35
10246970--10247018
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10247173--10247232
16
3.8
16
86
6
77
30
1
1
66
1.11
10247180--10247221
7
5.6
7
88
8
57
30
0
2
66
1.04
10259213--10259770
89
6.2
89
92
0
918
26
18
19
35
1.95
10259213--10259908
267
2.5
268
89
5
1006
27
17
19
35
1.95
10259734--10259781
15
3.3
15
82
5
53
16
12
6
64
1.46
10259556--10259908
192
1.8
193
82
5
455
27
17
18
36
1.93
10260642--10260738
30
3.2
30
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0
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1.65
10261653--10261782
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15
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4
3
57
1.35
10261728--10261863
25
5.2
27
73
10
86
33
7
4
55
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362