Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  357  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117985306--117985441
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5.3
26
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22
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117985312--117985441
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22
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1.99
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20
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2.4
27
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5
76
21
25
17
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1.95
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5.0
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20
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1.84
117988095--117988225
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2.4
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126
28
7
23
40
1.82
117988095--117988249
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28
9
22
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1.84
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2.4
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54
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2.0
26
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2.0
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0
0
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6
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2.7
22
80
14
63
26
1
8
63
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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75
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1
0
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17
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55
0
0
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19
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1.82
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20
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64
0
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19
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0
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3
3
58
1.35
118027355--118027416
21
3.0
21
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32
4
1
61
1.27
118027421--118027475
28
2.0
28
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3
76
40
1
1
56
1.21
118027421--118027493
28
2.6
27
80
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2
1
58
1.21
118027901--118027951
22
2.3
22
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1
27
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0
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2.3
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3.3
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2.0
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2.0
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39
0
0
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2.1
19
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23
10
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17
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12
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39
1
0
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0
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0
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2.4
47
84
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154
25
16
23
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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1
1
53
1.22
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2.0
25
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0
6
46
1.27
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1.9
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0
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0
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2.1
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13
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13
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0
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0
81
0.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118115499--118115562
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3.0
21
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0
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0
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0.86
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2.5
24
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0
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0.88
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0
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0
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0
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0.96
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13
3.7
13
78
18
53
0
34
0
65
0.93
118115930--118116046
30
3.9
29
77
11
94
44
3
22
29
1.69
118115945--118116046
30
3.4
30
84
2
134
44
3
22
29
1.71
118116042--118116076
14
2.4
15
90
4
54
25
0
2
71
1.00
118116317--118116532
51
4.1
53
86
8
298
37
17
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28
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118116512--118116545
14
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14
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0
17
20
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10
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36
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18
26
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118116795--118116828
16
2.1
16
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0
50
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9
324
36
18
18
26
1.93
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192
2.2
192
97
0
799
34
20
13
30
1.92
118128974--118129018
21
2.1
21
84
8
56
37
4
8
48
1.55
118128997--118129516
17
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17
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180
43
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2.7
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4.4
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17
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0
0
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11
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5
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0
20
0
79
0.73
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15
2.5
15
87
4
51
0
2
12
84
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
36
0
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0.95
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24
2.5
24
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2
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0
31
0
68
0.90
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10
2.9
10
100
0
58
0
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0
62
0.96
118130204--118130249
13
3.7
13
81
18
62
0
36
0
63
0.95
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22
29
1.69
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22
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0
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23
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108
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24
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1.68
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2.0
46
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0
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0
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1.69
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22
0
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2.0
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105
50
0
13
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22
2.0
22
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10.0
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0
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0
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33
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6
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6
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28
2.2
29
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1
1
28
1.08
118190588--118190635
22
2.2
22
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4
2
27
1.21
118190596--118190658
27
2.2
28
83
5
74
68
1
1
28
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118197130--118197167
18
2.1
18
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0
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52
5
2
39
1.38
118197137--118197183
20
2.5
20
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62
55
6
2
36
1.37
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2.1
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0
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0
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1.26
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22
2.0
20
82
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50
48
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0
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1.35
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2.0
64
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0
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0
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0
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10.0
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0
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3
30
0
66
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362