Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  346  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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Period
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1.93
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90
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15
24
26
1.95
115112612--115112765
12
13.1
12
71
23
89
34
1
1
62
1.15
115112615--115112718
14
7.4
16
76
19
60
33
2
0
62
1.16
115112624--115112757
43
3.1
41
73
13
110
33
2
0
63
1.12
115113139--115113173
18
1.9
18
88
0
52
17
0
8
74
1.06
115133126--115133165
13
3.1
13
77
0
53
30
7
27
35
1.84
115142413--115142446
16
2.1
17
88
5
52
47
0
0
52
1.00
115143130--115143159
14
2.1
14
93
0
51
26
0
10
63
1.26
115152603--115152644
18
2.3
18
92
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68
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2
11
9
1.12
115157867--115158180
105
3.0
105
81
1
317
35
12
21
30
1.90
115159927--115160042
58
2.0
58
100
0
232
53
10
8
27
1.64
115160847--115160923
13
5.9
13
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75
37
23
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32
1.80
115180239--115180268
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
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2.1
14
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0
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0
23
1.11
115186776--115186842
33
2.0
33
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0
125
22
34
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26
1.95
115189638--115189702
18
3.4
18
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7
0
60
1.25
115189809--115189881
30
2.5
30
80
8
87
30
12
2
54
1.51
115194362--115194439
39
2.0
40
87
7
115
69
8
7
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1.36
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53
2.0
53
100
0
212
32
11
26
30
1.91
115196099--115196325
44
5.2
44
66
10
158
27
22
23
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115196093--115196508
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4.8
88
89
2
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29
22
22
25
1.99
115196129--115196369
43
5.5
43
67
15
161
27
21
24
26
1.99
115196196--115196571
88
4.3
86
84
5
242
30
22
23
23
1.99
115196534--115197115
44
13.6
42
71
13
295
30
20
22
26
1.98
115196617--115197033
41
9.8
41
71
12
202
30
19
22
27
1.98
115196531--115196812
124
2.3
124
98
0
546
31
19
21
27
1.97
115196658--115197066
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2.4
170
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563
30
20
22
26
1.98
115196739--115197111
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4.3
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29
21
22
26
1.99
115196739--115197115
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12
218
29
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23
25
1.99
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1.9
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276
28
21
24
26
1.99
115196513--115197116
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3.5
171
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525
30
20
23
25
1.98
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18
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32
7
0
60
1.25
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2.5
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30
12
2
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1.9
107
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31
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28
1.97
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1.9
19
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10
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41
2
0
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1.13
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2.2
23
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2
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1.42
115212226--115212267
21
2.0
21
90
0
66
14
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7
21
1.61
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28
2.0
28
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0
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0
0
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1.00
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17
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0
52
50
0
0
50
1.00
115221640--115221699
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2.7
23
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16
56
63
0
0
36
0.95
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2.3
31
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4
81
60
2
0
36
1.11
115221920--115221978
31
1.9
31
82
6
75
27
18
1
52
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115227584--115227666
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2.0
41
100
0
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34
9
19
36
1.84
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124
2.0
125
90
0
388
34
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42
1.75
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24
2.0
24
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4
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51
0
8
40
1.33
115244622--115244647
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2.4
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100
0
52
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0
34
1.50
115244783--115244917
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157
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2.4
18
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20
25
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75
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0
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28
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125
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510
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0
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1.43
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3.2
24
78
14
77
53
28
1
15
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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