Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  161  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52975581--52975718
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3.7
37
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0
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29
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3.3
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16
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20
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3.2
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20
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1.9
126
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19
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2.6
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90
0
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2.1
26
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18
18
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2.8
26
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2
83
27
22
23
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20
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3
171
19
22
18
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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1.85
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3.8
43
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147
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19
23
1.98
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43
3.8
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136
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19
24
1.98
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2.3
21
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20
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2.0
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2.0
26
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0
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5.6
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266
28
26
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53155874--53155947
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2.0
37
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1.95
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241
30
27
15
26
1.96
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25
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1.82
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18
2.3
17
86
8
53
38
5
12
43
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53218921--53219071
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2.0
75
90
2
241
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1.69
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4.0
138
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5
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1.59
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1.24
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29
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0
103
33
21
28
16
1.95
53224310--53224375
32
2.1
32
97
0
123
33
22
9
34
1.86
53227037--53227111
28
2.7
28
91
0
123
36
12
21
30
1.90
53233008--53233042
16
2.3
15
90
5
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28
5
2
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1.32
53241738--53241784
18
2.6
18
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19
8
0
72
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53243671--53243709
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1.9
20
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2
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53245237--53245314
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2.0
39
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0
156
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10
23
35
1.88
53246786--53246895
28
4.0
28
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4
118
32
13
26
27
1.94
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2.00
53250501--53250666
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2.1
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23
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26
2.00
53250501--53250700
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24
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2.00
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265
24
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25
2.00
53258366--53258567
78
2.6
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25
2.00
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29
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1.97
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7
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0
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0
29
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1.25
53272527--53272666
37
3.8
37
94
0
244
25
30
20
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53272839--53273338
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48
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0
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28
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2.1
35
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0
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1.75
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18
5
48
1.69
53279811--53279862
13
3.9
13
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0
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27
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1.99
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2.1
119
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1.99
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1.92
53290037--53290186
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223
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12
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1.92
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40
6.3
40
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308
27
28
20
23
1.99
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2.1
116
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3
378
27
28
20
23
1.99
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15
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18
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31
1.95
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2.0
150
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0
536
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30
1.88
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2.0
21
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0
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4
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1.34
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2.0
78
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1.99
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3.1
39
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0
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22
23
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1.99
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8
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2.1
19
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48
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5
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0
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48
6.9
48
72
9
237
27
19
28
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53350364--53350679
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3.3
93
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7
368
27
18
28
25
1.98
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24
2.2
24
89
0
79
16
9
16
56
1.65
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24
2.2
24
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14
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1.60
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2.7
19
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16
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1.62
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2.0
291
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19
2.2
18
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4
71
42
15
2
40
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362