Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  229  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77455906--77456428
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47
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0
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1.98
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1.98
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20
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29
1.96
77512255--77512374
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2.9
42
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15
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1.97
77538826--77538978
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2.3
64
83
6
180
33
16
27
22
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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32
2.5
33
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2
1
48
1.23
77579857--77579947
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2
2
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77587719--77587766
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20
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25
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1.98
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29
1.98
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1.96
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0
103
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119
20
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1.98
77615587--77615701
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0
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24
1.99
77625387--77625609
119
1.9
120
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301
25
27
21
24
1.99
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4.3
40
90
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249
26
28
20
24
1.99
77633507--77633716
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2.6
79
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217
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28
20
25
1.99
77633509--77633731
119
1.9
120
80
6
265
26
27
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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1.98
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1.98
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199
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27
20
22
1.98
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1.8
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92
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28
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1.98
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15
4.4
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15
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15
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19
30
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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28
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27
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12
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0
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0
42
1.31
77725361--77725542
28
6.5
28
92
1
276
28
12
25
32
1.93
77742661--77742694
11
3.2
11
91
4
52
23
47
17
11
1.81
77752749--77752845
37
2.8
36
89
9
141
23
31
19
24
1.98
77752986--77753275
48
6.0
48
92
0
472
32
26
5
35
1.80
77761519--77761583
29
2.2
30
88
2
96
44
10
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38
1.64
77761610--77761722
32
3.5
32
83
2
127
41
15
5
38
1.69
77776601--77776712
43
2.6
43
84
5
129
27
19
25
26
1.99
77780300--77780326
13
2.1
13
100
0
54
14
25
37
22
1.93
77785176--77785230
28
2.0
28
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0
101
34
34
9
21
1.85
77788438--77788503
29
2.3
28
89
2
96
45
10
7
36
1.67
77788438--77788515
29
2.6
30
85
6
88
43
8
8
38
1.68
77788532--77788650
34
3.5
34
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0
148
46
19
2
31
1.63
77789493--77789592
43
2.3
43
78
0
110
32
24
15
29
1.95
77792296--77792351
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2.7
21
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0
94
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32
16
1.90
77799023--77799242
45
5.0
45
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3
261
26
25
20
27
1.99
77800034--77800172
47
3.0
46
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1
206
45
15
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26
1.82
77806457--77806630
45
4.0
45
83
6
207
26
28
21
24
1.99
77806457--77806630
90
2.0
87
85
8
237
26
28
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77807434--77807575
47
3.0
46
87
5
205
45
13
12
28
1.80
77808649--77808695
21
2.2
21
100
0
94
31
0
14
53
1.42
77809602--77809656
29
1.9
28
89
10
85
20
45
21
12
1.84
77813354--77813485
28
4.7
28
77
17
139
23
32
15
28
1.95
77813356--77813492
57
2.4
57
82
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24
32
15
27
1.95
77816413--77816631
46
4.7
46
74
10
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24
27
18
30
1.98
77816505--77816633
48
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80
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23
26
20
30
1.98
77818580--77818627
25
2.0
24
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64
12
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1.49
77819364--77819423
28
2.1
29
84
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3
0
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1.16
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3
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3
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0
121
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1
0
64
1.03
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4
14.0
4
80
14
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25
5
1
67
1.21
77819796--77819839
20
2.2
20
92
8
72
25
4
2
68
1.20
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13
2.1
13
100
0
54
29
0
22
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1.51
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3.7
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10
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25
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1.97
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27
5.4
27
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195
35
20
21
22
1.96
77843321--77843449
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2.8
46
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0
231
25
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1.94
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2.0
30
84
6
79
31
24
6
37
1.81
77848513--77848550
19
2.0
19
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10
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7
21
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1.77
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32
2.0
32
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0
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30
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22
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1.96
77858551--77858817
40
6.7
40
95
0
480
29
20
28
21
1.98
77867363--77867668
40
7.7
40
95
0
551
29
20
28
21
1.98
77871410--77871676
40
6.7
40
88
8
393
22
27
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77871410--77871676
81
3.3
80
88
7
393
22
27
21
28
1.99
77880145--77880408
40
6.7
40
91
4
437
22
28
20
29
1.98
77887274--77887324
25
2.0
26
92
3
86
43
9
7
39
1.67
77889955--77890006
26
2.0
26
96
0
95
44
7
9
38
1.66
77891998--77892036
6
6.3
6
82
5
51
76
0
5
17
0.96
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1.9
40
91
0
125
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1.94
77897399--77897467
28
2.4
29
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10
28
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1.90
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32
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28
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1.96
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2.8
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185
30
17
29
22
1.97
77915962--77916026
21
3.1
22
79
14
75
12
36
24
26
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362