Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  351  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116362337--116362389
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26
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13
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2.3
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183
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227
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24
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1.82
116379127--116379980
412
2.1
412
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2
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23
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2.5
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21
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1.97
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3.5
44
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7
143
33
21
21
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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2.4
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1.96
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1
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3.2
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47
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4
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17
20
31
1.96
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20
31
1.96
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2.0
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52
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2
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2
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34
3
3
58
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2.0
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50
0
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50
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2
0
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53
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2.0
137
96
0
507
24
18
24
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.1
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535
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1.98
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15
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137
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35
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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29
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25
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69
41
12
1
44
1.53
116454668--116454719
21
2.7
20
80
16
56
36
1
5
55
1.35
116455151--116455217
16
4.2
16
77
19
61
37
2
1
58
1.23
116455151--116455220
33
2.0
36
81
13
85
35
2
1
60
1.21
116456867--116456918
5
9.6
5
81
8
50
21
3
0
75
0.97
116456867--116456924
11
5.1
11
77
6
53
20
3
0
75
0.94
116457877--116457908
15
2.1
16
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18
12
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62
1.50
116461356--116461437
38
2.1
40
84
8
107
58
2
2
36
1.24
116461393--116461428
14
2.5
15
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0
0
33
0.92
116461411--116461519
30
3.6
29
74
15
87
64
1
5
28
1.26
116461447--116461499
7
7.3
7
77
14
54
69
1
3
24
1.15
116461588--116461702
12
9.5
12
66
24
55
58
4
1
35
1.28
116461616--116461694
22
3.6
21
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56
3
0
39
1.17
116461613--116461702
26
3.5
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4
0
38
1.19
116461778--116461829
9
5.7
9
80
11
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55
0
3
40
1.18
116461776--116461823
18
2.7
18
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0
4
39
1.19
116463607--116463642
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0
54
52
2
19
25
1.59
116463478--116464047
89
6.7
87
77
12
414
35
18
17
28
1.94
116463717--116464482
73
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77
74
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523
33
21
16
28
1.95
116463878--116464047
87
2.0
86
90
4
270
36
18
17
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.1
152
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10
779
33
21
16
28
1.95
116463956--116464500
148
3.7
146
83
9
663
34
21
16
28
1.95
116464253--116464431
86
2.1
86
87
5
254
40
21
13
24
1.90
116464339--116464493
72
2.2
73
85
3
208
35
21
16
25
1.95
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3
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0
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0
32
0
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10.8
46
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1
757
22
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14
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0
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0
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0.68
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34
1.84
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4.2
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2.0
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1.80
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2.4
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35
14
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1.80
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5.1
45
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172
24
28
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1.95
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205
3.5
205
92
0
1187
27
22
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1.98
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2.1
44
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0
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26
16
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1.96
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44
10.4
44
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362
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1.98
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132
3.4
132
94
0
755
27
25
18
29
1.98
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27
2.2
26
90
6
87
1
10
0
87
0.62
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21
2.3
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7
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2
10
0
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19
3.2
21
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6
64
36
19
9
34
1.84
116485244--116485341
19
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19
90
7
155
35
17
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1.84
116485244--116485341
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2.6
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9
144
35
17
10
36
1.84
116485600--116485668
26
2.6
25
72
17
59
57
4
4
33
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116485842--116485877
14
2.5
15
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9
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0
0
33
0.92
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2.8
31
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4
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1.23
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38
2.1
42
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8
122
59
2
2
35
1.23
116485863--116485948
22
4.0
21
72
14
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2
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25
1.22
116486009--116486172
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12
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3
1
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1.25
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0
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4
0
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1.18
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2
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1.28
116486228--116486283
18
3.1
17
80
10
67
58
0
3
37
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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