Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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347
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6
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127
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17
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1.94
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16
19
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1.94
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135
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19
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30
16
19
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1.94
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16
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2.0
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27
18
22
31
1.97
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2.7
86
84
6
270
28
17
19
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1.94
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145
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643
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16
18
32
1.94
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1.8
217
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2
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0
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22
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1.96
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2.3
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35
21
20
22
1.96
5834184--5834222
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2.6
14
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12
51
2
15
2
79
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5835082--5835142
18
3.3
18
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29
1
4
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1.24
5835191--5835240
22
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22
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3
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20
14
4
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0
110
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0
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0
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0
80
0.82
5837288--5837328
18
2.3
19
79
12
50
53
7
7
31
1.56
5837546--5837589
19
2.2
21
84
11
58
29
4
2
63
1.26
5837723--5837766
17
2.6
17
92
3
72
45
43
9
2
1.48
5839067--5839152
33
2.5
35
74
14
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37
5
2
54
1.37
5839585--5839640
19
3.0
19
78
17
64
35
1
5
57
1.32
5844291--5844332
14
3.1
14
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3
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4
9
42
1.58
5845432--5845477
22
2.1
22
100
0
92
60
13
4
21
1.49
5850813--5850870
24
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26
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5
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62
1
8
27
1.35
5851744--5851794
18
2.8
18
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41
17
19
21
1.91
5852001--5852025
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0
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0
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6
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10
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2
0
19
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20
2.1
21
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4
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70
2
0
27
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20
2.0
20
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0
20
0.90
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2
0
20
0.88
5852112--5852197
9
9.6
9
87
0
118
25
8
20
45
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
17
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21
3
6
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1.26
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3
8.7
3
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0
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0
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0
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2.2
22
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3
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21
38
19
21
1.94
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52
1.9
52
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4
119
28
13
4
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3.0
14
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1.71
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4.0
22
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22
5
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1.75
5884273--5884333
32
1.9
32
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0
104
49
18
4
27
1.68
5884273--5884346
32
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18
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26
20
26
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2.0
36
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26
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0
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15
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16
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16
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70
2
0
27
0.98
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11
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11
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2
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1.15
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1
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1
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52
0
2
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28
1.9
28
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1
1
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1.22
5942978--5943009
14
2.3
14
94
0
55
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5943918--5943957
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2.9
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10
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0
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1.19
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0
0
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16
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0
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2
0
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2.2
51
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100
0
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0
0
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0
0
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2.8
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75
0
22
1
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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