Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  291  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1
39
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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463
25
24
20
29
1.99
97960845--97960890
14
3.1
14
85
11
65
34
6
23
34
1.81
97960848--97960904
30
2.0
28
83
16
73
29
5
28
36
1.79
97962841--97962881
21
2.0
21
85
0
55
31
26
29
12
1.92
97963744--97964013
47
5.8
45
73
12
188
23
28
19
28
1.98
97963792--97964007
46
4.6
46
77
14
176
22
29
19
28
1.98
97963792--97963963
93
1.8
95
83
12
230
23
30
19
26
1.98
97968916--97968946
7
4.4
7
91
0
53
16
0
35
48
1.46
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24
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75
68
1
0
30
0.99
97969127--97969185
21
2.8
22
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70
69
6
0
23
1.12
97969211--97969275
22
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21
75
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67
67
0
1
30
1.00
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12
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13
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51
37
0
0
62
0.96
97970871--97970901
14
2.2
14
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19
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1.84
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19
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0
0
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1.00
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4.0
22
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13
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29
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97972391--97972451
32
1.9
32
90
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49
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1.71
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17
2.0
17
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5
50
45
0
6
48
1.27
97986776--97986816
18
2.2
19
83
12
50
26
2
4
65
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97991404--97991449
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24
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0
74
45
8
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23
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13
3.2
13
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57
36
0
7
56
1.27
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22
1.9
22
85
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33
0
4
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1.17
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18
3.5
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12
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12
16
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2.0
19
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7
0
7
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6
0
6
0.70
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0
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1.87
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1.89
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2.1
22
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28
13
0
58
1.35
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21
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37
9
0
52
1.34
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1.9
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2.1
22
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0
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0
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1.21
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2.2
20
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4
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52
9
7
30
1.61
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2.7
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0
0
45
1.00
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1.99
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2.5
17
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0
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0
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0.79
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3.1
12
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11
58
83
0
0
16
0.64
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12
2.9
11
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16
50
26
0
2
70
1.01
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12
2.1
12
100
0
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60
0
0
40
0.97
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2.7
14
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0
58
55
0
10
34
1.34
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2.5
126
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1
494
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15
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98038369--98038411
22
2.0
21
86
4
59
23
4
4
67
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98039799--98039848
11
4.6
10
82
9
55
42
0
30
28
1.56
98039799--98039848
21
2.3
21
80
16
57
42
0
30
28
1.56
98040252--98040327
32
2.4
31
82
8
82
46
1
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1.24
98043588--98043641
18
2.9
19
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42
7
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98045723--98045759
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1.9
19
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0
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19
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2
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2.3
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0
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0
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2.3
14
100
0
64
21
0
21
56
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362