Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  188  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
30
25
1.99
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.0
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29
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.81
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1.81
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16
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
1.96
62658102--62658662
27
20.8
27
86
0
728
40
9
21
28
1.84
62660675--62660776
6
16.8
6
75
17
95
50
13
16
19
1.78
62660654--62660776
30
4.1
29
81
9
131
49
13
17
19
1.79
62661244--62661326
27
3.1
26
87
5
112
36
22
22
18
1.95
62661520--62661925
27
15.0
27
87
1
526
41
10
20
27
1.85
62663826--62663913
34
2.6
34
82
7
106
27
26
21
25
1.99
62665495--62665638
40
3.6
40
88
1
182
26
28
20
24
1.99
62670913--62670945
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
62676160--62676197
13
2.9
13
88
0
58
52
7
0
39
1.31
62680390--62680615
40
5.7
40
86
3
262
26
27
22
23
1.99
62680366--62680615
80
3.2
80
84
3
301
26
26
22
24
2.00
62688206--62688346
46
3.0
47
81
8
160
34
14
24
26
1.94
62691627--62691671
20
2.2
20
88
0
63
48
2
13
35
1.54
62697627--62697948
48
6.7
48
81
6
314
28
20
28
22
1.99
62697627--62697951
144
2.3
142
84
7
390
28
20
28
22
1.99
62702690--62702748
31
1.9
31
96
0
109
16
25
35
22
1.95
62710501--62710539
20
2.0
20
85
10
53
38
17
0
43
1.50
62722332--62722383
20
2.6
20
96
0
95
26
32
28
11
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62728742--62728824
43
1.9
43
85
0
112
24
15
30
30
1.96
62730323--62730424
48
2.1
48
89
3
152
27
21
21
29
1.99
62730343--62730445
48
2.3
46
85
8
131
27
19
22
31
1.98
62732521--62732582
28
2.2
28
97
0
115
37
8
20
33
1.83
62732523--62732570
16
3.2
16
66
22
50
37
6
20
35
1.78
62733903--62733948
20
2.2
20
84
3
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47
2
13
36
1.54
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21
2.6
21
96
0
99
18
29
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16
1.93
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49
4.9
50
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7
246
25
18
27
28
1.98
62741214--62741265
16
3.3
15
79
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48
1
34
15
1.56
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15
2.6
17
77
18
52
43
0
2
53
1.13
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94
2.0
93
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5
231
40
8
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48
1.46
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22
2.0
22
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0
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33
2
15
48
1.57
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22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
62757412--62757449
18
2.1
19
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51
26
18
10
44
1.82
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15
2.7
16
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45
0
2
52
1.13
62761981--62762022
15
2.9
15
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47
0
0
52
1.00
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2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
62762248--62762315
16
4.2
16
96
0
118
35
36
0
27
1.58
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74
2.0
74
94
0
254
48
7
13
30
1.69
62764392--62764442
14
3.5
14
77
15
50
49
1
0
49
1.12
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1.9
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83
10
171
20
30
16
33
1.94
62774890--62775045
68
2.2
68
78
11
156
21
28
15
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62775162--62775196
17
2.1
17
100
0
70
28
17
11
42
1.83
62782520--62782624
43
2.4
43
91
0
174
32
20
14
32
1.93
62797448--62797478
15
2.1
15
93
0
53
25
19
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41
1.87
62808400--62808439
16
2.5
16
87
0
62
50
5
12
32
1.62
62812878--62813081
85
2.4
86
81
7
236
27
12
24
34
1.92
62812878--62813081
43
4.8
43
77
10
193
27
12
24
34
1.92
62821646--62821705
29
2.1
29
90
0
93
23
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0
177
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1.82
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2.2
54
94
0
206
27
21
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42
1.83
62825159--62825489
27
12.2
27
74
11
106
39
19
8
32
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362