Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  284  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.14
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
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20
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
14
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
4
1
66
1.17
95766867--95766965
18
5.6
18
75
16
82
29
4
1
65
1.17
95767033--95767083
3
16.0
3
84
11
50
31
0
5
62
1.19
95770459--95770556
27
3.5
28
87
2
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27
13
27
31
1.94
95770487--95770570
27
3.0
27
84
5
78
30
11
23
33
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95780018--95780090
15
5.0
16
68
24
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20
26
0
53
1.46
95781215--95781254
20
2.0
20
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9
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25
7
0
67
1.16
95787620--95787672
22
2.4
22
100
0
106
22
43
22
11
1.85
95797596--95797661
31
2.1
31
100
0
132
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24
22
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1.97
95798081--95798349
48
5.6
48
80
5
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24
28
18
28
1.98
95798076--95798350
96
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96
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2
338
24
28
18
28
1.98
95798081--95798349
144
1.9
144
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7
341
24
28
18
28
1.98
95804991--95805089
32
3.1
32
85
0
108
29
24
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1.88
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27
1.98
95805131--95805293
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2.9
56
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25
29
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1.98
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55
2.0
55
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3
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27
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1.98
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2.0
23
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0
56
23
32
8
34
1.86
95825931--95825957
14
1.9
14
100
0
54
37
0
29
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95836119--95836392
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5.5
49
80
5
309
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19
24
29
1.98
95836114--95836399
100
2.9
100
91
0
466
26
19
24
29
1.99
95838151--95838434
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5.9
48
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229
26
28
17
27
1.97
95838164--95838370
96
2.2
95
85
3
272
26
29
17
26
1.98
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2.0
107
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1
367
38
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1.87
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26
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0
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2.5
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3
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0
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0
26
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0.84
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46
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0
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20
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2.0
17
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59
48
0
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1.45
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2.3
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4
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40
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14
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0
14
14
1.15
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26
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5
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17
2.7
18
86
6
69
72
0
10
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1.12
95903945--95903979
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4.0
9
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7
54
71
0
11
17
1.14
95903937--95903985
9
6.1
8
77
20
50
71
0
14
14
1.15
95903993--95904055
30
2.1
30
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7
28
0
1.22
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10.2
5
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38
0
26
34
1.57
95905355--95905401
15
3.1
15
87
0
67
38
0
27
34
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95905810--95906004
45
4.3
45
90
0
282
18
20
21
40
1.92
95906178--95906375
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5.5
34
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9
128
35
11
15
37
1.83
95906187--95906380
18
10.8
17
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16
108
35
11
15
38
1.83
95906178--95906380
72
2.8
72
79
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191
35
11
15
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1.83
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18
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0
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2.0
27
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42
18
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95914322--95914388
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24
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0
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2
0
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2.0
93
97
0
354
36
19
23
20
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362