Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  265  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.94
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13
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1.94
89410851--89411002
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2.8
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17
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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2.4
28
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29
23
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
1.96
89456457--89456612
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1.9
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233
29
28
15
26
1.96
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199
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34
29
1.93
89521526--89521646
60
2.0
60
91
0
197
34
19
23
22
1.96
89521758--89521886
67
1.9
67
85
3
179
25
17
31
25
1.97
89522008--89522052
20
2.1
23
88
12
69
57
8
11
22
1.60
89522984--89523065
41
2.0
41
92
0
137
26
15
21
35
1.94
89529205--89529380
67
2.6
67
97
0
325
17
29
22
30
1.97
89529291--89529342
27
2.0
26
88
3
77
17
25
21
36
1.94
89529358--89529421
33
2.0
33
87
3
94
21
23
20
34
1.97
89538413--89538471
27
2.2
26
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22
23
18
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1.96
89541141--89541189
23
2.2
22
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10
55
30
0
22
46
1.52
89541193--89541258
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2.0
33
100
0
132
24
6
21
48
1.72
89551371--89551430
30
2.0
30
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3
77
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3
23
33
1.71
89551986--89552021
18
2.0
18
100
0
72
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5
5
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1.49
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58
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20
2.8
18
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1
38
1.42
89589710--89589808
42
2.3
43
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21
21
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1.98
89595692--89595770
24
3.2
24
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22
15
29
32
1.95
89595660--89595839
50
3.6
50
92
0
272
24
17
27
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6.0
48
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3
263
27
18
29
24
1.98
89605726--89605998
96
2.9
95
80
3
298
28
19
28
23
1.98
89605711--89605996
144
2.0
143
81
3
333
27
18
29
24
1.98
89608592--89608632
20
2.0
20
100
0
82
24
19
24
31
1.98
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5
12.8
5
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20
5
1
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1.13
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2.5
40
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1.95
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2.0
34
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0
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1.87
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2.2
19
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45
0
2
52
1.13
89625071--89625109
16
2.5
15
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8
51
43
0
2
53
1.14
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2.3
23
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15
65
33
1
1
62
1.16
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172
2.0
171
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1
524
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7
14
41
1.74
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15
2.3
15
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0
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58
8
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17
1.61
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15
2.3
15
89
0
50
17
14
8
58
1.61
89634411--89634594
62
3.0
62
95
0
323
41
20
4
33
1.74
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5.1
11
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81
12
3
3
0.95
89635828--89635885
23
2.5
22
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12
3
3
0.95
89635828--89635885
6
10.2
6
71
17
52
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12
3
3
0.95
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108
1.8
108
92
0
329
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17
10
46
1.80
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95
9.0
95
95
0
1517
30
19
21
28
1.97
89637318--89638177
189
4.5
190
95
0
1517
30
19
21
28
1.97
89637318--89638177
284
3.0
285
95
1
1526
30
19
21
28
1.97
89638077--89638995
134
6.8
134
94
1
1568
27
19
22
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89638144--89638916
46
17.2
45
63
13
245
26
20
23
29
1.99
89638077--89638995
270
3.4
268
94
1
1568
27
19
22
29
1.98
89638077--89639089
404
2.5
404
92
1
1660
27
20
22
29
1.98
89638352--89639372
270
3.9
260
87
4
788
28
19
23
28
1.98
89639126--89639307
44
4.2
44
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5
109
27
21
25
25
2.00
89638884--89639372
130
3.8
130
91
1
757
29
19
23
26
1.98
89639057--89639371
43
7.3
42
66
7
139
28
19
25
26
1.99
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11
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0
54
0
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0.99
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3
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8
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31
4
5
59
1.38
89640956--89641001
23
2.0
23
83
8
58
32
2
8
56
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362