Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  337  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112173116--112173191
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3.2
25
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0
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2.2
23
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1.69
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20
2.0
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5
55
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2
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0
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2.6
41
98
0
203
28
21
22
27
1.99
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2.9
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108
30
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2.1
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20
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4
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2.0
17
88
0
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29
2
2
64
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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112242887--112242940
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112246303--112246354
24
2.2
24
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0
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2.0
26
84
0
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2.0
54
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35
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112292047--112292121
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2.7
27
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34
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0
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27
25
22
2.00
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1
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2.0
160
98
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626
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9
15
37
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
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0
24
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2.3
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37
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10
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2.0
108
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12
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2.0
28
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8
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1.84
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10
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19
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19
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19
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4
20
50
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112334198--112334283
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20
46
1.71
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75
38
15
6
38
1.74
112334742--112334794
14
3.7
14
87
5
79
37
13
5
43
1.67
112335718--112335760
19
2.3
19
100
0
86
44
4
18
32
1.71
112335948--112335981
13
2.6
13
80
0
50
38
0
2
58
1.13
112336325--112336352
14
2.0
14
100
0
56
64
7
0
28
1.20
112336577--112336604
13
2.2
13
100
0
56
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0
0
39
0.97
112345071--112345104
17
2.0
17
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0
59
44
50
0
5
1.26
112349700--112349733
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
112351783--112351840
17
3.3
17
74
9
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44
10
8
36
1.69
112351782--112351851
37
1.9
37
91
2
115
44
11
12
31
1.78
112352398--112352451
18
3.1
17
79
12
56
59
1
3
35
1.26
112352532--112352562
3
10.3
3
92
0
53
67
3
0
29
1.06
112352624--112352691
26
2.6
26
77
9
68
66
2
10
20
1.35
112352855--112352911
30
1.9
30
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3
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57
5
10
26
1.53
112353224--112353253
13
2.2
14
94
5
53
16
3
0
80
0.85
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21
2.4
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28
0
60
1.32
112368749--112368787
14
2.7
15
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8
62
64
2
5
28
1.28
112370091--112370203
44
2.5
45
82
5
131
25
24
17
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1.97
112370122--112370390
44
6.0
44
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12
163
25
22
21
30
1.99
112370099--112370521
180
2.3
180
88
1
634
25
21
22
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112370320--112370661
135
2.5
135
89
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528
25
20
23
30
1.98
112378672--112378702
5
6.0
5
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7
53
41
19
19
19
1.90
112382916--112382957
14
2.9
15
89
7
68
61
2
7
28
1.35
112386770--112386935
3
57.7
3
68
12
73
64
0
7
27
1.24
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23
4.4
23
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14
56
62
0
7
28
1.28
112386791--112386897
48
2.2
51
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8
141
61
0
7
29
1.29
112386766--112386861
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6.9
14
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14
92
62
1
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29
1.29
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13
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0
2
20
0.90
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10
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1.38
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15
5.2
15
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13
67
56
1
10
31
1.42
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19
2.3
19
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0
52
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2
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1.35
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2.0
35
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1.87
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2.0
35
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0
106
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2.1
12
100
0
50
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0
0.40
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19
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3
2
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1.29
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2.1
22
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63
2
0
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1.07
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10
20.8
9
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19
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2
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1.29
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13
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39
0
2
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2.0
76
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201
25
20
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1.81
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19
2.3
19
87
0
68
44
9
0
46
1.35
112432249--112432324
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2.4
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5
51
1.51
112441142--112441281
45
3.2
44
88
7
221
41
18
1
38
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112441154--112441285
42
3.1
42
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237
40
19
2
37
1.64
112441337--112441368
16
2.0
16
100
0
64
25
25
12
37
1.91
112444729--112444807
22
3.3
22
68
19
68
50
6
1
41
1.36
112444722--112444823
50
2.0
50
98
0
195
49
7
2
40
1.47
112444744--112444824
22
3.2
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20
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1.49
112444840--112444888
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2.2
22
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0
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26
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10
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0
0
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1.35
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11
3.5
11
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5
2
29
1.31
112453035--112453075
20
2.0
20
100
0
82
60
4
4
29
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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