Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  290  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97452174--97452316
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23
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6
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1.99
97452173--97452316
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3.0
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175
29
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22
25
1.99
97452509--97452572
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2.1
31
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0
101
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25
1.94
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97462812--97462850
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2.3
16
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10
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2.3
25
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21
1.97
97464884--97465125
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80
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21
23
21
1.97
97464884--97465125
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2.0
122
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4
290
33
21
23
21
1.97
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22
2.1
22
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50
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0
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22
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1.9
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0
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63
0
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0
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28
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18
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0
0
36
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97480453--97480646
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83
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6
18
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126
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0
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19
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18
2.4
18
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27
20
1.83
97491497--97491599
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2.1
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147
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7
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31
1.63
97491497--97491631
48
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132
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32
1.59
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52
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0
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1.31
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2.9
27
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0
84
19
20
33
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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12
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22
17
44
1.86
97530739--97530878
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140
15
20
17
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1.85
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48
0
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27
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97613151--97613206
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10
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20
0
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5
26
1.11
97623813--97623857
15
2.9
15
90
9
65
66
0
6
26
1.16
97623805--97623929
15
8.7
14
72
18
64
65
1
7
25
1.27
97623825--97623929
29
3.6
28
73
21
67
64
1
7
25
1.30
97624833--97624917
44
1.9
44
90
0
134
23
25
20
30
1.98
97624933--97625697
86
8.9
86
89
1
1045
20
22
20
36
1.95
97625786--97626192
84
4.8
84
89
1
602
18
23
22
35
1.96
97626188--97626284
44
2.2
45
80
14
112
27
20
17
34
1.95
97626298--97626394
45
2.2
44
87
7
133
28
22
17
30
1.97
97626187--97626602
178
2.3
178
92
0
663
27
21
19
31
1.97
97631014--97631057
19
2.4
19
85
11
56
47
13
18
20
1.82
97632573--97632625
24
2.0
24
86
13
70
58
3
9
28
1.47
97632573--97632627
28
2.0
28
82
13
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60
3
9
27
1.44
97635649--97635715
21
3.0
23
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21
72
64
0
5
29
1.17
97635629--97635745
29
4.0
28
68
21
71
64
0
8
26
1.28
97635682--97635727
15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
97635707--97635747
14
2.8
15
75
20
50
60
0
9
29
1.28
97635682--97635742
15
4.1
14
80
16
54
67
0
6
26
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97641774--97641818
19
2.2
21
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7
67
51
0
0
48
1.00
97641842--97641882
21
2.0
21
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9
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63
0
0
36
0.95
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16
3.3
16
75
8
61
64
0
0
35
0.94
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46
2.0
44
85
8
123
40
23
4
31
1.74
97648239--97648289
16
3.2
16
85
0
75
25
27
5
41
1.78
97653672--97653715
19
2.4
19
85
11
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47
13
18
20
1.82
97655230--97655282
24
2.0
24
86
13
70
58
3
9
28
1.47
97655230--97655284
28
2.0
28
82
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3
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27
1.44
97656299--97656344
22
2.1
22
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0
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26
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1.52
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2.0
14
100
0
56
35
28
7
28
1.84
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129
1.9
129
85
1
340
33
15
26
24
1.95
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12
2.1
12
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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20
2.7
18
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22
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51
4
2
42
1.32
97673398--97673431
16
2.2
15
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5
50
79
5
5
8
1.05
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5.2
9
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44
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25
1.82
97678056--97678090
6
5.5
6
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17
0
2
80
0.84
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14
100
0
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0
3
74
0.98
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13
2.3
13
94
0
51
10
3
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1.54
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26
2.2
26
81
6
62
40
0
3
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1.17
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2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
97689684--97689738
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16
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1
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32
1.24
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48
4.9
48
72
11
179
25
20
23
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97697679--97697713
13
2.7
13
95
0
61
5
28
48
17
1.69
97704178--97704329
74
2.1
74
94
0
268
25
17
25
31
1.97
97704359--97704462
48
2.2
48
85
0
136
25
21
25
27
1.99
97706310--97706433
33
3.9
32
72
15
112
29
17
27
25
1.98
97706207--97706398
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1.9
103
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2
224
32
16
25
26
1.96
97714272--97714308
19
1.9
19
100
0
74
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97718575--97718628
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2.1
26
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0
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1
0
31
0.99
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3.2
22
81
17
89
65
0
0
34
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362