Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  170  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56113294--56113421
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26
2.7
26
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24
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1.9
119
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24
1.99
56133405--56133646
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6.1
40
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291
25
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21
24
1.99
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24
2.00
56141392--56141615
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212
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18
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2.2
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2.1
21
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41
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10
120
32
25
19
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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0
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2.0
30
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0
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22
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37
1.84
56206146--56206260
29
4.0
29
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1.94
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25
28
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24
1.99
56221212--56221436
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5.7
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6
233
25
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25
1.99
56221368--56221445
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26
28
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1.99
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1.98
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17
2.6
17
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2.0
16
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55
70
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2.4
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75
1
15
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19
28
27
1.99
56271963--56272213
119
2.1
120
90
1
407
23
19
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
27
27
1.99
56280072--56280282
79
2.7
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327
24
20
27
27
1.99
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2.0
30
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19
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53
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20
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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54
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24
17
39
1.92
56368882--56369043
46
3.7
45
79
14
194
32
30
17
19
1.95
56368939--56368997
19
3.0
20
71
14
68
28
33
18
18
1.95
56371393--56371479
30
3.0
30
79
11
92
57
16
16
10
1.65
56371393--56371470
15
5.4
15
77
11
83
58
14
16
10
1.62
56374416--56374585
46
3.7
46
72
13
141
32
28
16
21
1.95
56385442--56385626
40
4.6
39
83
7
180
24
22
27
25
2.00
56385442--56385626
79
2.3
81
82
9
220
24
22
27
25
2.00
56385495--56385659
79
2.1
79
82
8
194
26
21
26
26
1.99
56404794--56404922
28
4.6
28
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100
24
29
17
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1.97
56404819--56404945
56
2.3
56
82
5
159
25
29
16
28
1.97
56419864--56420068
27
7.6
27
85
4
252
29
28
15
26
1.96
56428075--56428279
27
7.6
27
85
4
252
29
28
15
26
1.96
56430435--56430470
18
2.0
19
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2
5
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69
1.22
56432140--56432270
58
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58
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0
208
10
10
39
38
1.75
56449709--56449765
28
2.0
29
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10
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33
8
8
49
1.65
56449825--56449866
22
2.1
19
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13
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45
0
0
54
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56449825--56449863
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2.5
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8
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46
0
0
53
1.00
56450155--56450191
14
2.5
16
83
16
53
27
40
13
18
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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0
0
38
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14
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15
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27
0
20
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1.47
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39
6.0
39
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1
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22
24
29
23
1.99
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39
6.0
39
90
2
351
22
25
28
23
1.99
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44
2.3
44
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0
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14
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1.95
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2.0
30
90
0
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28
25
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38
1.84
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1.97
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26
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1.95
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2.3
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100
0
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28
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25
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1.94
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2.5
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41
13
5
40
1.66
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25
2.1
24
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68
36
13
23
26
1.92
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131
23
19
25
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1.98
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3.9
43
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10
142
35
26
14
23
1.93
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44
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22
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23
9
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1.85
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2.0
37
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0
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10
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18.3
6
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21
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49
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19
1.79
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25
2.8
25
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0
84
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18
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2.3
31
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4
126
49
15
15
19
1.80
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31
2.8
25
77
19
82
46
15
19
18
1.84
56537811--56537899
19
4.7
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15
51
48
14
17
19
1.81
56538304--56538499
27
7.3
27
86
0
266
23
20
20
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56538504--56538778
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10.2
27
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4
331
40
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28
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56558364--56558396
16
2.0
17
88
5
50
39
6
18
36
1.75
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49
3.6
49
80
11
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25
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17
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1.97
56563626--56563679
24
2.2
26
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12
69
38
5
0
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2.0
22
83
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56
6
6
29
1.51
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2.6
206
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0
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0.87
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24
2.5
24
86
5
75
0
20
0
79
0.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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