Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  232  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78445403--78446140
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125
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1.91
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2.9
248
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3
922
29
18
15
37
1.91
78445403--78446140
373
2.0
374
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3
1004
29
18
15
37
1.91
78446243--78446343
35
2.9
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2
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0
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0
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1
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2.3
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23
1.99
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1.98
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26
18
26
1.98
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2.3
22
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0
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1
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42
3.7
42
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3
208
30
14
25
29
1.95
78533699--78533855
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1.9
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217
30
14
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29
1.95
78533698--78533872
85
2.1
83
81
6
208
29
14
25
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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17
21
1.86
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49
2.1
49
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0
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9
17
16
1.67
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12
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25
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1.99
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1.96
78538573--78538776
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241
26
15
28
29
1.96
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21
2.1
21
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48
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1.96
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3.6
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24
26
24
2.00
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24
1.99
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28
1.98
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40
2.8
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116
25
21
28
24
1.99
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2.2
20
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1.98
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1.9
53
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0
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13
19
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20
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41
88
0
500
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19
1.96
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0
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3
25
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1.70
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24
2.1
24
82
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58
1
1
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1.20
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1.80
78622915--78623034
62
2.0
62
94
1
215
20
7
18
54
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
100
0
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1
0
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1.11
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9
17.0
9
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180
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15
1
36
1.55
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43
2.4
43
86
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136
24
28
20
26
1.99
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43
2.1
43
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171
23
36
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22
1.95
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3.2
25
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7
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1.83
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2.0
27
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20
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2.0
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2.5
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2
2
29
1.22
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4
3
27
1.31
78644840--78644880
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19
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1.8
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96
0
317
27
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78654313--78654488
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29
21
20
1.98
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29
29
19
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1.98
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28
29
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21
1.98
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93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
78672797--78672972
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
78680208--78680381
46
3.8
46
78
14
205
28
29
20
20
1.98
78680215--78680385
92
1.8
93
94
1
308
28
29
21
21
1.98
78681760--78681813
27
2.0
27
100
0
108
37
11
7
44
1.68
78687918--78688134
46
4.7
43
79
12
186
28
19
29
22
1.98
78696291--78696335
16
2.8
16
82
3
54
26
31
20
22
1.98
78698208--78698240
13
2.4
14
90
5
50
54
9
0
36
1.32
78701537--78701671
39
3.5
39
91
0
207
45
20
3
29
1.68
78701559--78701670
22
5.5
22
66
27
68
47
20
3
28
1.67
78711347--78711530
40
4.6
40
81
6
187
23
20
27
28
1.99
78711347--78711527
80
2.3
81
83
9
212
23
20
27
28
1.99
78711427--78711577
40
3.8
39
80
6
126
25
21
27
25
1.99
78719292--78719435
40
3.6
40
77
10
118
23
20
27
29
1.99
78727056--78727211
82
1.9
81
85
3
215
26
16
28
28
1.97
78727055--78727208
55
2.9
52
82
7
175
27
16
27
27
1.97
78727056--78727211
27
5.7
27
81
6
163
26
16
28
28
1.97
78727048--78727232
27
6.8
27
75
9
101
26
16
28
29
1.97
78727048--78727232
82
2.3
81
78
2
210
26
16
28
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78735121--78735242
27
4.5
27
80
6
124
26
16
29
27
1.97
78735112--78735242
54
2.4
55
80
11
153
27
16
28
28
1.97
78736598--78736847
48
5.2
48
80
2
261
29
19
28
22
1.98
78736592--78736885
96
3.1
96
81
2
340
28
19
28
23
1.98
78736617--78736880
48
5.5
48
78
6
230
28
20
28
22
1.98
78754339--78754366
14
2.0
14
100
0
56
35
0
14
50
1.43
78754612--78754660
25
2.0
24
88
11
73
48
22
8
20
1.75
78755805--78755914
42
2.6
42
83
7
127
30
20
11
37
1.89
78756748--78756789
21
2.0
20
90
4
66
42
28
4
23
1.74
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7
7.3
7
80
4
59
30
50
0
19
1.48
78757144--78757194
14
3.6
14
83
2
66
29
50
0
19
1.48
78757183--78757267
14
6.0
14
80
2
89
49
28
1
21
1.57
78757183--78757267
21
4.0
21
82
1
89
49
28
1
21
1.57
78757617--78757806
40
4.8
40
78
7
170
26
20
21
32
1.98
78757856--78757947
40
2.3
40
81
5
114
28
20
17
33
1.95
78771725--78771900
46
3.8
45
81
10
212
21
21
29
28
1.98
78771721--78771892
93
1.8
93
94
0
308
20
21
30
27
1.98
78774814--78774897
29
2.9
29
82
10
100
10
16
15
57
1.65
78774823--78774901
15
5.4
15
80
10
92
10
17
12
59
1.60
78777282--78777457
46
3.8
45
81
10
212
21
21
29
28
1.98
78777278--78777449
93
1.8
93
94
0
308
20
21
30
27
1.98
78785406--78785536
43
3.0
43
80
9
151
24
17
24
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78792842--78792926
42
2.0
42
97
0
161
28
9
17
44
1.80
78807910--78808060
67
2.3
66
78
12
157
21
29
16
31
1.96
78812431--78812460
15
2.0
15
100
0
60
26
40
0
33
1.57
78814366--78814477
49
2.3
48
83
7
129
26
17
29
25
1.98
78814389--78814477
24
3.7
24
83
7
101
28
17
29
24
1.98
78817336--78817410
28
2.7
28
89
4
116
29
24
13
33
1.93
78817451--78817498
23
2.1
23
100
0
96
41
29
8
20
1.81
78825591--78825813
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216
25
21
27
25
1.99
78825671--78825848
79
2.2
80
82
3
200
25
21
28
24
1.99
78830010--78830151
70
2.0
70
98
0
275
19
25
30
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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