Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  253  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85565612--85565818
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1.9
30
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29
24
7
38
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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2.0
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1.99
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280
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1.99
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4.8
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92
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26
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2
236
25
28
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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52
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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24
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46
2.2
46
100
0
204
20
5
27
46
1.74
85869896--85870041
73
2.0
73
95
2
267
31
24
16
27
1.96
85872228--85872256
13
2.2
13
100
0
58
37
20
0
41
1.53
85878227--85878252
13
2.0
13
100
0
52
30
0
7
61
1.24
85879636--85879799
40
4.1
40
92
2
269
23
21
26
27
1.99
85890044--85890157
43
2.7
43
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124
29
25
20
24
1.99
85897192--85897282
42
2.1
42
82
7
112
29
29
13
27
1.94
85897165--85897282
43
2.8
43
78
6
125
29
27
15
27
1.96
85902283--85902307
13
1.9
13
100
0
50
48
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0
44
1.32
85904807--85904888
41
2.0
41
97
0
155
23
36
9
30
1.87
85905239--85905303
17
3.9
17
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15
73
76
1
4
16
1.02
85905239--85905313
5
13.8
5
76
15
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76
2
4
17
1.06
85905239--85905314
11
6.9
11
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2
3
17
1.06
85910714--85910738
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1.32
85918286--85918325
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1.9
21
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0
53
30
2
22
45
1.66
85930481--85930831
44
7.8
44
74
9
271
30
18
22
28
1.97
85931309--85931344
12
3.0
12
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0
54
58
8
19
13
1.61
85935899--85935984
27
3.2
27
75
6
102
32
17
4
45
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85935885--85935999
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2.1
55
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1
214
33
16
5
45
1.70
85935914--85935994
27
3.0
26
75
7
99
32
16
4
46
1.68
85936586--85936624
17
2.4
16
87
8
53
41
15
2
41
1.61
85939321--85939522
83
2.4
83
87
3
291
32
14
11
41
1.82
85939944--85940145
83
2.4
83
87
3
291
32
14
11
41
1.82
85939264--85940510
623
2.0
623
99
0
2476
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19
13
35
1.91
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17
2.0
17
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0
50
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2
0
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1.05
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17
2.0
17
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8
0
20
1.11
85948460--85948576
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2.0
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1
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1.61
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2.0
29
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3
78
14
19
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1.86
85958786--85958818
16
2.1
16
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3
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9
3.7
9
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0
57
39
24
12
24
1.89
85960298--85960332
18
1.9
18
100
0
70
37
22
11
28
1.89
85960412--85960444
13
2.5
13
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0
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9
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2.3
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8
266
28
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28
24
1.98
85968145--85968303
27
5.9
27
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10
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25
20
1.97
85968145--85968306
54
3.0
54
90
2
247
33
21
25
19
1.97
85968684--85968714
8
3.9
8
91
0
53
3
25
25
45
1.69
85969892--85970000
26
4.2
26
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0
191
35
23
7
33
1.83
85978895--85978954
30
2.0
30
96
0
111
31
20
21
26
1.98
85982896--85983148
40
6.3
40
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0
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21
27
26
1.99
85992272--85992361
44
2.0
44
84
4
117
35
25
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85992347--85992386
16
2.5
16
88
8
55
30
22
7
40
1.81
85993764--85993820
24
2.4
24
85
5
62
63
0
0
36
0.95
85993751--85993813
30
2.0
33
87
9
96
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1
1
38
1.17
85993756--85993821
30
2.2
31
84
13
84
60
1
0
37
1.06
85998235--85998388
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47
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12
112
22
1
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85998202--85998792
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5.7
101
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1
13
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1.44
85998202--85998824
310
2.0
306
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4
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1
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1.45
85998202--85998824
207
3.0
204
83
8
676
27
1
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1.45
85999167--85999192
13
2.0
13
100
0
52
46
7
7
38
1.61
86001287--86001448
40
4.0
41
79
1
168
30
21
21
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362