Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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82
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2.9
17
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18
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43
11
7
37
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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19
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1
5
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1485154--1485243
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55
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2.1
25
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149
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19
34
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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2.0
20
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62
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1561212--1561271
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0
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129
37
37
0
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51
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3
0
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1.12
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3
17.7
3
81
11
65
33
1
1
62
1.16
1587959--1587995
19
2.0
18
89
5
56
62
2
2
32
1.23
1596491--1596537
23
2.0
23
87
0
67
25
17
12
44
1.84
1596673--1596706
2
17.0
2
100
0
68
50
0
50
0
1.00
1598528--1598576
24
2.0
24
88
7
73
59
0
0
40
0.98
1599447--1599478
15
2.1
15
94
5
55
56
0
9
34
1.32
1610678--1610730
21
2.6
20
73
8
54
54
0
0
45
0.99
1610628--1610797
89
1.9
89
85
4
236
47
1
2
48
1.22
1616655--1616687
11
2.9
12
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13
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33
0
0
66
0.92
1616809--1616868
30
2.0
30
87
3
86
55
11
6
26
1.60
1616902--1616944
22
2.0
22
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0
59
58
11
11
18
1.63
1616909--1616949
11
3.7
11
80
0
55
56
9
14
19
1.66
1618486--1618597
43
2.6
43
95
0
206
29
32
26
11
1.92
1618590--1618942
38
9.3
38
91
1
564
30
25
22
20
1.99
1632747--1632788
13
3.3
13
83
9
52
28
0
9
61
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1633145--1633191
20
2.4
21
83
16
57
40
2
0
57
1.11
1634476--1634519
22
2.0
22
95
0
79
34
4
36
25
1.76
1639013--1639043
11
2.8
11
95
0
53
9
9
0
80
0.90
1639357--1639400
22
2.0
22
95
0
79
34
4
36
25
1.76
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27
2.0
27
92
0
90
24
16
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1.92
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30
2.1
27
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9
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58
1
0
40
1.08
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19
1.9
19
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0
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2
0
35
1.10
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0
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22
15
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1.57
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2.3
46
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138
17
23
16
43
1.88
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110
1.9
110
88
2
319
19
24
14
41
1.89
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92
4.1
92
95
0
680
24
23
13
38
1.91
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8.2
46
90
0
601
24
23
13
38
1.91
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30
3.0
31
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7
105
58
4
0
36
1.18
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7
3.7
7
100
0
52
30
0
0
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2.2
16
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23
11
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1.43
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7
3.9
7
100
0
54
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0
0
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3
100
0
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0
0
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17
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2
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1.56
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2.1
86
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4
223
36
9
12
41
1.76
1683585--1683628
20
2.2
20
87
0
61
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0
59
1.10
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37
2.0
37
100
0
148
37
13
16
32
1.87
1684649--1684687
14
2.9
14
82
17
55
69
0
0
30
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1690483--1690524
21
2.0
22
85
4
59
38
11
4
45
1.62
1692859--1692959
30
3.5
30
66
8
91
36
5
3
53
1.44
1692839--1692965
57
2.2
57
98
0
245
33
4
4
57
1.40
1702572--1702631
3
20.0
3
85
0
75
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0
58
1.20
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12
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12
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20
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32
9
0
56
1.39
1702796--1702881
3
29.0
3
72
11
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9
1
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1.39
1705219--1705288
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2.4
29
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3
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0
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1705610--1705660
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15
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0
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1.13
1705614--1705671
24
2.4
24
85
0
80
56
0
6
36
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362