Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  217  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73205657--73205729
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0
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2.1
21
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3.0
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14
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0
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2.8
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340
39
19
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1.92
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25
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1.65
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1.76
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2
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0
0
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1.9
24
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8
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6
0
31
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73229608--73229651
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2.0
22
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63
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4
2
20
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5
6.8
5
93
0
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17
14
1.88
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35
2.2
35
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0
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1
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1.43
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16
2.4
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56
2
0
41
1.13
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19
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19
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9
66
39
0
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53
1.28
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18
3.1
18
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40
0
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52
1.28
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12
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1.90
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10.0
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1
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4.0
26
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0
154
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6
23
36
1.81
73243039--73243142
52
2.0
52
92
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172
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23
36
1.81
73245927--73246002
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2.9
26
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40
0
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55
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2.0
28
100
0
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25
21
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4.5
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1.80
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12
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0
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9
4.7
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81
2
0
16
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21
2.1
21
87
8
63
75
6
0
18
1.02
73259711--73259769
28
2.0
29
90
6
93
76
5
0
18
0.97
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2.4
45
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4
132
29
16
24
29
1.97
73261125--73261250
44
2.8
43
81
8
110
30
15
26
27
1.95
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178
4.4
178
83
4
941
29
15
26
28
1.96
73261436--73261718
88
3.2
88
68
8
225
27
15
25
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73261078--73261764
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356
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931
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16
25
28
1.97
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45
9.4
45
69
7
178
29
15
26
28
1.96
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90
2.2
90
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1
242
31
15
23
28
1.95
73261346--73262161
444
1.8
447
84
2
1124
29
16
26
27
1.97
73261925--73262033
44
2.4
46
83
6
143
27
16
25
30
1.97
73261790--73262161
178
2.1
179
84
1
487
29
18
26
26
1.98
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23
2.3
22
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0
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64
1.11
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21
31
18
27
1.97
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93
2.3
95
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264
21
31
19
27
1.97
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5.2
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240
21
30
19
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1.98
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19
28
1.98
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1.9
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1.98
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2.1
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1.15
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2.0
41
86
9
114
31
27
18
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73341369--73341518
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
73341393--73341576
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
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1.9
27
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77
37
9
7
45
1.67
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57
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20
4
46
1.71
73351707--73351786
40
2.0
40
97
0
151
25
11
25
38
1.88
73357972--73358008
16
2.3
16
90
0
56
37
10
24
27
1.88
73359124--73359157
17
1.9
18
88
5
52
23
0
2
73
0.97
73359715--73359771
23
2.5
23
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5
71
19
5
28
47
1.71
73359715--73359773
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21
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18
5
27
49
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73367066--73367237
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1.8
93
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0
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22
1.99
73367059--73367234
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45
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13
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29
27
21
21
1.99
73371847--73371881
17
2.1
17
100
0
70
51
11
8
28
1.67
73375234--73375398
40
4.2
39
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1
258
23
22
26
27
2.00
73375234--73375398
79
2.1
79
90
2
260
23
22
26
27
2.00
73383303--73383508
40
5.2
40
95
0
351
22
21
27
27
1.99
73394633--73394884
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4.7
54
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234
21
25
17
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1.95
73394677--73394877
108
1.8
110
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22
25
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1.96
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1.96
73411706--73411862
86
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194
24
15
26
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1.96
73425865--73425979
44
2.7
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25
1.98
73432991--73433030
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1.9
21
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0
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35
7
35
22
1.82
73442049--73442130
27
3.2
27
70
16
93
18
31
24
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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49
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0
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20
31
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25
1.98
73462997--73463113
29
4.1
29
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4
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41
17
12
28
1.87
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29
2.5
29
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2
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45
18
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26
1.81
73465370--73465420
23
2.2
23
85
0
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27
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0
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1.50
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28
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88
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1.85
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21
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1.96
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2.1
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0
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1.9
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1.70
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0
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1.98
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17
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0
28
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1.95
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4.4
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10
309
23
29
14
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73585825--73586220
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2.0
198
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0
765
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1.95
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3.8
28
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1.90
73588219--73588317
26
3.6
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28
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1.88
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1.9
18
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20
1.93
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1.98
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1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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