Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  30  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8736732--8736771
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20
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0
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2.0
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25
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3.0
29
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40
10
15
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2
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8767407--8767577
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1.8
93
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21
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28
1.98
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215
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21
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29
1.99
8774971--8775140
92
1.8
92
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0
313
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21
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28
1.99
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2.3
40
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0
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1.94
8781500--8781592
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2.3
40
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0
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15
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2.0
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2.0
23
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8791187--8791219
17
2.0
17
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0
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138
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382
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40
3.3
40
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0
133
26
19
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1.97
8797785--8797838
28
1.9
28
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0
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27
12
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1.93
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32
1.74
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3.2
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76
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91
44
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1.74
8819038--8819114
18
4.3
18
72
6
75
42
12
9
35
1.75
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18
1.9
18
94
0
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28
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8
45
1.77
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3.8
20
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0
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35
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2.0
40
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4
121
31
25
4
37
1.77
8828500--8828559
29
2.1
29
81
6
68
26
3
3
66
1.23
8828539--8828595
19
3.0
18
87
7
69
42
8
1
47
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8832612--8832738
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3.6
35
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2
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9
30
1.88
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4.9
55
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15
281
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16
19
32
1.94
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3.0
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8
0
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1.23
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37
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20
140
22
8
0
68
1.16
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14
7.2
14
76
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99
21
7
0
70
1.12
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7.1
18
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22
70
24
7
0
68
1.14
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25
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21
7
0
71
1.10
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5
0
72
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151
22
7
0
70
1.10
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1.9
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187
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0
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1.31
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11
82
5
88
19
16
0
63
1.31
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5.1
16
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11
96
21
15
0
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1.33
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20
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19
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0
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1.17
8844963--8845001
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0
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1.12
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14
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14
0
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109
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11
255
34
20
15
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8848355--8848732
175
2.2
166
82
6
425
34
19
15
30
1.92
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2.1
15
100
0
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25
34
0
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1.56
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0
0
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0
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0
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50
28
0
7
64
1.19
8858717--8858798
19
4.4
19
72
6
69
67
2
1
29
1.11
8859151--8859265
10
11.3
10
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26
55
26
1
3
67
1.16
8859107--8859267
9
18.7
9
68
19
69
29
2
3
65
1.21
8859210--8859277
31
2.2
32
86
2
93
23
1
2
72
1.07
8859244--8859366
27
4.8
25
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16
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27
4
3
65
1.26
8860942--8860967
9
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9
100
0
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0
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1.34
8869674--8869708
17
2.1
17
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0
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22
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1.84
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28
2.6
28
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27
27
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1.94
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19
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21
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0
6
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1.25
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15
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2.5
41
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0
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17
19
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1.94
8886156--8886235
19
4.3
19
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36
10
17
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1.83
8887408--8887443
15
2.4
15
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0
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22
16
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1.70
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20
2.0
21
82
13
52
61
4
0
33
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8893512--8893552
16
2.5
17
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11
59
31
26
7
34
1.84
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15
1.9
16
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6
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43
0
3
53
1.17
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19
2.0
20
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15
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39
23
0
36
1.55
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46
2.7
46
93
0
199
29
27
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21
1.98
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29
27
20
21
1.98
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5.1
40
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1
347
22
23
28
25
1.99
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2.1
19
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4
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56
0
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1.40
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2.0
20
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7
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0
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3
0
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2.1
98
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23
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1.91
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32
23
11
32
1.91
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3.0
65
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23
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30
1.92
8921358--8921578
33
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32
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31
23
13
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1.93
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29
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6.8
32
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24
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31
1.93
8928362--8928599
98
2.4
98
78
2
244
30
25
12
32
1.92
8928407--8928583
65
2.7
65
77
0
165
35
23
12
29
1.91
8928439--8928598
32
4.9
32
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2
113
33
23
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1.90
8929681--8929717
18
2.1
18
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0
56
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1.62
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55
0
0
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2.0
23
95
0
81
46
6
13
33
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8948734--8948873
40
3.4
42
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12
130
29
27
14
29
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8952379--8952595
106
2.0
107
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276
29
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2.0
215
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0
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0
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0
0
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0
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0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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