Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  330  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110168472--110168517
9
4.8
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50
13
17
19
1.78
110168472--110168517
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2.4
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58
50
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17
19
1.78
110170789--110170874
3
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19
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65
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1.17
110170784--110170874
30
3.0
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3
31
1.17
110170829--110170883
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6.2
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1
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0
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2.2
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20
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2.0
84
84
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20
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182
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20
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1.98
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20
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61
2.0
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23
25
25
2.00
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2.6
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2.1
12
100
0
50
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0
16
16
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110229423--110229471
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19
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0
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4
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2.2
25
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27
5
0
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1.13
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12.3
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1.96
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12
2.3
12
100
0
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25
2.2
25
83
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27
5
0
66
1.13
110249148--110249195
9
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2
2
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17.0
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77
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1
62
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0
0
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0
0
69
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0
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0
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25
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1.96
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2.2
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2.1
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100
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22
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4.2
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2
180
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23
7
32
1.83
110282802--110282908
51
2.1
52
94
1
189
36
23
7
32
1.83
110293136--110293168
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2.0
17
88
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50
48
6
15
30
1.69
110300577--110300713
39
3.5
38
77
6
132
28
27
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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58
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0
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2.6
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79
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44
30
0
25
1.54
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25
2.0
23
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71
69
4
0
26
1.06
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2.7
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22
0
5
71
1.07
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2.2
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70
1.21
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20
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1
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56
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1
40
1.37
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1
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0
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1.16
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2.0
29
89
0
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22
8
8
59
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110368170--110368219
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24
24
10
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210
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210
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0
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1.97
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0
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31
2
0
65
1.07
110386738--110386768
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16
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0
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3
6
0
90
0.55
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24
2.0
24
100
0
96
58
4
4
33
1.36
110391301--110391352
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1.9
27
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70
21
11
11
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1.66
110391495--110391552
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3.0
19
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7
55
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15
3
68
1.32
110395688--110395768
25
3.2
24
74
6
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24
18
16
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110404604--110404671
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110404603--110404676
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2.8
27
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0
4
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110409079--110409120
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20
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21
1.52
110409284--110409321
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0
7
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1.17
110420957--110420988
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0
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0
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2.0
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86
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1.93
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24
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1.97
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2.0
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0
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2.0
23
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37
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0
150
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13
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1.77
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20
4.0
21
74
15
60
28
5
1
65
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
27
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79
27
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2
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1.28
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45
7.3
45
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14
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26
26
1.95
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3.7
90
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1
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32
15
26
26
1.95
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77
2.0
77
93
0
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25
24
1.94
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33
14
26
25
1.94
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2.0
168
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0
462
34
14
25
25
1.94
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90
2.8
90
90
0
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25
1.95
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0
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1.79
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1.9
354
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1
1023
37
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23
20
1.94
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1.9
16
93
0
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1.97
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44
2.3
45
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1
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19
25
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1.99
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27
28
1.97
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1.9
50
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0
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1.97
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2.1
27
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0
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31
1
3
63
1.22
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2.1
27
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24
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0
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10
0
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0
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110488005--110488083
28
2.8
29
88
7
94
49
3
8
37
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110488021--110488083
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2.2
28
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0
108
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3
11
34
1.54
110488024--110488092
28
2.5
28
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4
104
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2
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33
1.46
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2.1
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0
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0
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0
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22
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110491702--110491975
121
2.3
121
83
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329
23
21
18
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362