Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  153  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50379893--50379948
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10
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
18
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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198
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21
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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21
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1.51
50512964--50513221
40
6.5
40
87
4
346
23
23
27
25
2.00
50520371--50520541
93
1.8
93
96
0
315
36
13
13
36
1.84
50520742--50520789
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
50524758--50524854
30
3.2
30
70
8
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28
28
14
27
1.95
50527542--50527579
17
2.2
18
85
4
51
63
2
23
10
1.39
50527561--50527615
12
4.6
12
73
15
51
63
0
23
12
1.29
50531350--50531402
12
4.6
12
81
13
67
71
5
5
16
1.25
50531351--50531402
22
2.3
23
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3
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71
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17
1.26
50532321--50532376
5
10.8
5
76
17
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78
1
17
1
0.92
50532324--50532374
21
2.4
22
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70
80
1
15
1
0.89
50532324--50532374
15
3.2
16
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8
68
80
1
15
1
0.89
50532316--50532372
25
2.3
24
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11
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0.96
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12
19
22
1.84
50532462--50532508
24
2.0
24
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4
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63
2
19
14
1.40
50532457--50532524
30
2.3
30
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1
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13
1.33
50534665--50534752
30
2.9
30
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6
88
28
28
15
27
1.96
50535651--50535699
20
2.3
20
82
10
53
32
8
14
44
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50537331--50537379
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4.5
11
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7
64
10
2
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81
0.94
50537331--50537379
22
2.3
22
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73
10
2
6
81
0.94
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1.9
16
100
0
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0
0
51
1.00
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2.1
21
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8
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0
0
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0.95
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2.0
79
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0
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32
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11
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1.74
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40
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22
28
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1.99
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22
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1.62
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19
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1
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24
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27
26
1.99
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19
2.1
19
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0
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25
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22
1.95
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4.5
13
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5
5
16
1.20
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1
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3
0.98
50576256--50576296
16
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15
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0
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2.1
21
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0
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2.7
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101
27
29
16
27
1.97
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27
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27
85
0
387
41
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30
1.80
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108
3.0
108
89
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461
40
20
7
31
1.80
50589503--50589870
81
4.5
80
79
6
348
40
21
7
30
1.81
50589503--50589869
108
3.4
106
84
5
398
40
20
7
30
1.81
50589503--50589877
27
13.9
27
79
7
275
40
20
8
31
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50589853--50589927
27
2.8
26
68
8
69
36
22
9
32
1.86
50589909--50590103
27
7.3
27
85
0
257
34
20
21
24
1.96
50590533--50590594
22
2.8
22
80
7
72
20
22
22
33
1.97
50590753--50590826
27
2.8
27
89
2
105
17
24
21
36
1.95
50590963--50591104
6
22.8
6
73
17
112
18
17
15
48
1.81
50590963--50591104
31
4.5
31
96
0
239
18
17
15
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50593790--50593821
11
2.9
11
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0
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1.65
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30
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1.84
50614273--50614332
17
3.5
17
72
17
52
28
30
8
33
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362