Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  248  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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2.1
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5
31
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
107
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17
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10
74
37
16
13
32
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
22
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54
70
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5
15
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
1.27
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17
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0
22
0
0.78
83912041--83912103
29
2.2
29
97
2
119
73
0
26
0
0.84
83912039--83912101
23
2.6
23
82
10
72
73
0
26
0
0.84
83912442--83912479
20
1.9
20
84
10
51
60
0
10
28
1.30
83913785--83913812
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
83916013--83916188
45
4.0
44
79
5
138
27
21
18
32
1.97
83916016--83916413
44
9.0
44
78
4
289
28
19
18
34
1.95
83916013--83916604
89
6.5
88
72
10
370
27
19
18
33
1.95
83916023--83916413
133
2.9
134
77
7
391
28
19
18
33
1.95
83926198--83926360
46
3.5
46
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10
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23
29
18
28
1.98
83929119--83929167
14
3.5
14
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10
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44
10
10
34
1.72
83929117--83929176
28
2.1
28
100
0
120
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11
10
38
1.75
83932118--83932161
12
3.7
12
84
9
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4
6
27
1.41
83953904--83953963
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46
1
1
50
1.21
83958182--83958255
35
2.1
35
82
2
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27
21
25
25
2.00
83977567--83977666
47
2.1
47
96
0
182
29
15
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1.88
83981661--83981720
25
2.4
25
85
0
84
30
15
28
26
1.96
83982359--83982400
21
2.0
21
90
0
66
40
21
0
38
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83982359--83982397
5
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5
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5
51
41
20
0
38
1.53
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18
2.5
18
85
3
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63
0
0
36
0.95
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137
2.0
137
88
3
409
40
13
11
34
1.81
83995280--83995327
18
2.7
18
76
0
60
41
6
45
6
1.54
83997293--83997339
16
2.9
16
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0
58
46
21
21
10
1.81
83998672--83998734
25
2.5
25
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19
22
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1.97
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2.0
13
100
0
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0
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1.42
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25
1
1
70
1.05
84020269--84020330
23
2.5
24
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15
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1
0
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1.9
21
100
0
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12
20
25
1.86
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1.9
18
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0
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1.41
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3.1
37
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0
185
28
31
18
21
1.97
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100
3.4
96
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494
30
26
6
36
1.82
84024020--84024353
48
6.8
48
88
7
494
30
26
6
36
1.82
84024020--84024353
147
2.3
148
97
0
634
30
26
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1.82
84024323--84024516
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28
28
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1.88
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25
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22
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30
27
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1.87
84029700--84029745
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2.5
18
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54
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0
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1.32
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1.9
19
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29
1.40
84048067--84048275
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4.8
44
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0
193
31
16
19
33
1.94
84057812--84058127
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44
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12
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32
18
20
28
1.96
84058582--84058607
13
2.0
13
100
0
52
46
15
23
15
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84059627--84059663
19
1.9
19
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10
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18
8
2
70
1.25
84064061--84064100
21
2.0
20
95
5
71
80
0
0
20
0.72
84064061--84064100
16
2.5
17
88
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80
0
0
20
0.72
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3.2
41
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12
143
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23
15
25
1.94
84070433--84070472
20
2.0
21
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10
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10.0
3
100
0
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0
0
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2.5
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0
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57
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0
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1.24
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27
0
2
69
1.00
84073029--84073071
18
2.1
22
84
16
58
27
0
2
69
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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